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5核酸与生命遗传

5` UpCpUpApApAp GpUpApAp 3` IVS Pre-rRNA 5` UpCpUp Ap Ap Ap GpUpApAp 3` pGOH A B A B 5` UpCpUOH3` 5`pGpApApAp GpUpApAp 3` A B 5` UpCpUpUpApAp 3` A B rRNA 5`pGpApApA GOH3` IVS 19个核苷酸残基 IVS 3、核酸的变性、复性和杂交 :双螺旋区氢键断裂,空间结构破坏,形成单链无规线团状,只涉及次级键的破坏。 (1)核酸的的变性 Tm Tm DNA变性是个突变过程,类似结晶的熔解。将紫外吸收的增加量达到最大增量一半时的温度称熔解温度(melting temperature, Tm)。 影响Tm的因素: (1)G-C的相对含量 (G+C)% =(Tm — 69.3)× 2.44 (2)介质离子强度低,Tm低。 (3)高pH下碱基广泛去质子而丧失形成氢键的能力。 (4)变性剂如甲酰胺、尿素、甲醛等破坏氢键,妨碍碱基堆积,使Tm下降。 (2)核酸的复性(退火) :变性核酸的互补链在适当条件下重新缔合成双螺旋的过程。 影响复性速度的因素: (1)单链片段浓度 (2)单链片段的大小 (3)片段内重复序列的多少 (4)溶液离子强度的大小 (5)溶液温度的高低 (T – 25℃) (3)核酸的杂交 :在退火条件下,不同来源的DNA互补区形成氢键,或DNA单链和RNA链的互补区形成DNA-RNA杂合双链的过程。 探针:用放射性同位素或荧光标记的DNA或RNA片段。 原位杂交技术:直接用探针与菌落或组织细胞中的核酸杂交,未改变核酸所在的位置。 点杂交:将核酸直接点在膜上,再与核酸杂交。 Southern印迹法:将电泳分离后的DNA片段从凝胶转移到硝酸纤维素膜上,再进行杂交。 Northern印迹法:将电泳分离后的RNA吸印到纤维素膜上再进行分子杂交。 5.5 核酸碱基顺序的测定 一、DNA碱基顺序测定方法 1、DNA碱基顺序测定的基本步骤 (1)DNA片段的制备:限制性内切酶技术,PCR技术 (2)DNA碱基顺序测定 目前多采用Maxam-Gilbert法(化学降解法)和Sanger法(末端 终止法)。 2、化学法( Maxam-Gilbert法) (1)碱基选择性水解 限制性内切酶:1979年,W.Arber,H.Smith,D.Nathans等人发现, 主要在细菌中产生,具有极高的专一性,识别DNA双链上特定 的位点,将两条链都切开,形成粘性末端或平末端,只降解外 来DNA,酶切位点通常具回文结构。 EcoRⅠ: -N-C-T-T-A-A-G-N-5` 5`-N-G-A-A-T-T-C-N- HindⅢ: -T-T-C-G-A-A-5` 5`-A-A-G-C-T-T- 1)嘌呤碱基选择性水解:硫酸二甲酯处理DNA单链 2)嘧啶碱基的选择性水解: DNA单链用肼处理 (2) DNA片段电泳图谱的解析:将水解产物混合物进行凝胶电泳 ,得到电泳图谱。 5`-ATTGACTTAGCC-3` ATT+ACTTAGCC ATTGACTTA+CC ATT+ACTTA+CC 在G处切断 电泳,并用32P标记5`末端,根据电泳结果,推出G在第4位和第 10位。同理,推出A,C,T的位置. 3、末端终止法(Sanger法) (1)末端终止法合成不同长度DNA小片段,加入ddNTP,终止DNA 的合成。 O HOH2C H H OH 1′ 2′ 3′ 4′ 5′ 核 糖 N N N N H H H H 9 腺嘌呤 ddATP P P P 在DNA聚合酶的作用下,以DNA单链为模板,小 片段DNA为引物,将4种dNTP聚合成DNA互补 链. 引入ddNTP和32P标记的dATP (2)DNA小片段(合成产物)电泳图 谱的解析 4、DNA自动测序法:以Sanger法为基础,以荧光标记物代替同 位素标记,以不同颜色的因荧光代表4种碱基。 二、RNA碱基顺序测定方法 根据逆转录法,合成cDNA,再测定cDNA的碱基顺序,再得出 RNA的碱基顺序。 5.6 核酸的生物学功能 一、DNA复制与生物遗传信息的保持 复制要点: (1)在复制起始,DNA的双螺旋拆分成两条单链。 (2)以DNA单链为模板,按碱基互补配对原则,在DNA聚合酶 催化下,合成与模板DNA完全互补的新链,并形成新的DNA分子。 (3)新形成的DNA分子与原来的DNA分子完全相同。子代DNA 分子中,一条来自亲代DNA分子,另一条是新合成的,称为半保 留复制。 二、RNA与生物遗传信息的表达 1、基因的转录——mRNA的合成 转录要点:以DNA为模板,在RNA聚合酶作用下,合成mRNA。 在mRNA分子中,

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