2013年微生物生态与海洋环境论坛暨高通量测序数据信息挖掘技术.PDFVIP

2013 年微生物生态与海洋环境论坛 暨高通量测序数据信息挖掘技术培训班 (第二轮通知) 通过新一代测序技术，测定 16S rRNA 等标签序列，是微生物生态学研究革 命性的技术进步，目前已经迅速发展成为微生物组学相关研究的主流手段。其中， 如何对高通量测序序列进行处理和计算，是相关技术的核心，也是传统微生物学 研究团队用好该技术的瓶颈问题。为满足国内广大微生物生态工作者掌握生物信 息学分析手段的迫切需求，推动国内微生物生态学的快速发展，拟定于2013 年7 月 25-30 日在宁波举办生物信息技术研讨及培训班，宗旨是：（1）理解分析流程 中采用相关步骤的科学背景；（2 ）学会并实际操作以QIIME 为代表的微生物群落 分析工具。 高通量测序技术费用高、周期长、风险大，其实验设计的科学性及严谨性就 显得特别重要，因此，我们邀请了国内外著名微生物生态学和生物信息学专家就 微生物生态学中科学问题凝练、实验设计及数据分析等问题做主题报告和研讨， 并将为专家和参会人员提供一个较多时间的互动讨论平台。 本次培训班由中国生态学学会微生物生态专业委员会、宁波市科协主办；宁 波大学、宁波市海洋与渔业协会承办；中国科学院生态环境研究中心协办。具体 信息如下： 1. 生物信息学数据分析培训首席专家 周宏伟 教授，南方医科大学； 安东尼奥•冈萨雷斯 （Antonio González Pena ），研究员，Department of Chemistry and Biochemistry, University of Colorado, USA. Page 1 of 7 2. 论坛特邀讲座专家 a) 杰克.吉尔伯特（Jack Anthony Gilbert ）, 助理教授，Argonne National Laboratory, USA. b) 吴庆龙，中国科学院南京地理与湖泊研究所研究员、中国科学院大学教授。 c) 莫琳·科尔曼 （Maureen Lynn Coleman ），芝加哥大学助理教授。 d) 赵方庆，中国科学院北京生命科学研究院研究员。 3. 定位：参会人员及培训学员以微生物生态领域科研骨干和在读博士研究生 为主要培训对象，优先吸收已有微生物生态在研项目的科研人员。 4. 时间安排：2013 年7 月25-30 日 （25 日报到，26 日论坛，27-30 日培训）。 5. 承办单位：宁波大学海洋学院（中国微生物生态专业委员会微生物生态技 术培训基地）。 6. 举办地点：宁波万豪酒店二楼大厅（论坛部分）；宁波大学图书馆机房（数 据分析培训部分）。 7. 日程安排： （1）专题报告1 天 （上午3 个专家，下午3 个专家）： 具体日程及报告题目见7 月20 日的第三轮通知。国内专家的报告使用中文 讲解。 （2 ）生物信息学数据分析培训4 天。（周宏伟主讲, 安东尼奥·冈萨雷斯现 场咨询） a) 高通量测序分析微生物生态的进展史与关键点 b) 序列的处理与质控 c) 嵌合体序列去除与UCHIME 的使用 d) OTU 聚类（UCLUST ，TSC 等工具的使用） Page 2 of 7 e) Alpha 多样性分析（多样性指数，Chao，Shannon，PD ，以及Coverage ） f) 序列系统分类（RDP, GAST ） g) OTU 表格，热图，及相关统计分析 h) UniFrac 原理 i) Beta 多样性分析 j) PCoA 与Biplot k) QIIME 完整流程的自动化运行 l) 实验操作与数据分析对结果的影响 m) Sitepainter （备选） n) LEfSe o) 生态统计学 8. 数据分析培训软件运行平台：为保障每位参与者能够完成QII