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核DNA（nuclear DNA） 线粒体DNA (mtDNA) 基因组大小 3.2×109 bp 16 569bp 细胞内拷贝数 2（父母各提供一个等位基因） ﹥1000 细胞内DNA百分比 99.75% 0.25% 结构 线性；包裹在染色体内 环状 遗传来源 父亲和母亲 母亲 染色体配对 双倍型 单倍型 生殖重组 是 否 复制修复 是 否 特异性 个体特异性 （同卵双胞胎除外） 没有个体特异性 （同一母系亲属相同） 突变率 低 至少是核DNA的5倍～10倍 参考序列 2001年人类基因组计划发表 1981年Anderson等发表 * 参考序列 1981年在英国剑桥Frederick Sanger实验室首次对人类mtDNA序列进行了全序列测定。这个最初测定的序列作为比对的参考序列，通常被称为Anderson序列或剑桥参考序列。 1999年，Andrews et al对剑桥参考序列所用的胎盘样本进行了重新测序。更正了最初公布序列中的11个碱基。 * 剑桥参考序列和修正剑桥序列参考序列比较 碱基位置 线粒体基因组区域 原始剑桥参考序列 修正剑桥参考序列 备注 3106～3107 16S r RNA CC C 错误 3423 ND1 G T 错误 4985 ND2 G A 错误 9559 COⅢ G C 错误 11335 ND4 T C 错误 13702 ND5 G C 错误 14199 ND6 G T 错误 14272 ND6 G C 错误 14365 ND6 G C 错误 14368 ND6 G C 错误 14766 Cyt b T C 错误（插入Hela序列） * 正确的序列在nt3106～nt3107只有一个C，整个线粒体基因组是16568bp而不是最初报道的16569bp。 为了保持历史数据，在nt3107由一个缺失来占据一个位置。 法医学中最常应用的两个高变区的序列没有差异，它涵盖了nt16024～nt16365和nt73～nt340 * 参考序列 Anderson et al,1981. Anderson序列（GenBank：M63933）也称为剑桥参考序列（CRS）。过去依据与剑桥参考序列L链比较的差异报告结果 Andrews et al,1999. 修正的剑桥参考序列（rCRS）作为序列比对时的参照标准为16568bp,而不是传统所接受的16569bp Ingman et al,2000. NCBI人类基因组库用线粒体基因组参考序列（RefSeq mtGenome），GenBank中为16571bp * ? 每个细胞中线粒体基因组有多个拷贝 ? 母系遗传 ? 单倍型传递 mtDNA遗传标记的特点 * mtDNA 母系遗传模式 * mtDNA分型的法医学意义 在检测个体间的差异上，线粒体DNA不如其他方法有用。但mtDNA对陈旧骨、牙、严重腐败或焚烧的残骸以及单根毛干的检测成功率比核DNA高。 与核DNA相比，每个细胞中含有多个mtDNA拷贝。mtDNA的大拷贝数提高了从微量或严重降解的检材中得到足量DNA的成功率。在仅能得到毛发、骨、牙等组织的案件中，能提取得到的DNA量极少，这种情况下从mtDNA中得到分型结果的可能性远远高于核DNA遗传标记。 除非发生突变，同一母系中的个体具有相同的mtDNA序列。通常mtDNA在很多代当中的传递都是稳定的，通过mtDNA检测可以估计几代人间的亲缘关系。 * 法医mtDNA分型 个体间mtDNA差异最大的区域在D环区，包括高变区I（HV I，342bp）和高变区II（HV II,268bp）。无血缘关系个体中mtDNA的HV I和HV II区域变化率大约在1-3%，即每100个碱基就有1-3个不同，所检测的610个碱基有7-14个碱基不同。 * mtDNA频率估计 在包含N个mtDNA分型的数据库内，观察到一定次数（X）的某一mtDNA分型，其频率（p）用以下公式计算： ???? p=X/N 如果在数据库内未观察到分型，可信区间的上限为：1-α1/N α代表可信系数（0.05，95％的可信区间），N代表数据库内的个体数 例如,在1148个非裔美洲人分型中，mtDNA型16129A、263G、309d、315.1C观察到两次，调查mtDNA群体数据库时在686个西班牙人分型中未观察到，计算各个样本群体稀有分型如下： 非裔美洲人群：p=2/1148+1.96[(2/1148)(1-(2/1148))/1148]1/2 ?????????????? =0.0017+0.002=0.004=0.4% 西班牙人群：1-（0.05）1/686=1-0.9956=0.0044=0.44% * 检材状况不好(数量与质量)与测序技术潜在的误差,使被测样本