细胞黏附分子互作网络的构建与分析-生物化学与生物物理进展.PDFVIP

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 201 1, 38(4): 347~352 细胞黏附分子互作网络的构建与分析* 晓兰** ( 庆工商大学环境与生物工程学院，药物化学与化学生物学研究中心，重庆400067) 摘要 借助网络分析可对基因调控、蛋白质互作和信号转导等细胞活动进行全局和局部性质分析 以细胞黏附的蛋白质相互 作用为对象，通过数据挖掘和可视化软件构建了整合蛋白介导的黏附分子互作网络，该分子互作网络由 156 种蛋白质通过 690 种相互作用相连，其平均节点度为8.66、平均聚集系数为0.24，平均路径长度为2.6 黏附分子互作网络中包含数个功 能模块，这些模块涉及网络内部多种分子相互作用的启动与停止，并进一步影响细胞的黏附、迁移和骨架组织 对黏附分子 网络进行模体筛选和比较，发现一些数量相对较少、以三元复合物为主要结构的关键模体，同时对各网络模块和模体对细胞 黏附的调控作用进行了探讨 关键词 蛋白质相互作用，网络分析，系统生物学，黏附分子 学科分类号 Q50，Q51