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- 2018-05-02 发布于四川
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蛋白组学方法介绍.pptx
定量蛋白质组学张大伟天津工业生物技术研究所 zhang_dw@tib.cas.cn;蛋白样品制备
双向凝胶电泳
同位素标记技术(ICAT,iTRAQ,15N,SILAC)
无标记蛋白组学定量技术
定向蛋白质组学;蛋白质样品制备是蛋白质组研究的第一步,无论后续采用怎样的分离或鉴定手段,样品制备都是关键步骤。
; 基本原则:
(1)全息性(keep all of protein information),尽可能的制备所有蛋白;
(2)样品制备的方法还必须与后续的分离或鉴定方法相匹配,如采用双向电泳,需要谨慎使用SDS抽提蛋白质;如果用液相色谱分离,不应该用太多的去污剂和两性电解质(considering following protocols/kits ) ;
(3)由于样品来源千差万别,针对不同来源的样品(如细胞样品、动物组织样品、植物样品、体液等),需要采取不同的蛋白质抽提方法 (Different samples, different extraction) 。
;1)温和裂解方法 (细胞,血细胞, 细菌)
渗透裂解(Osmotic lysis)
冻融裂解(Freeze-thaw or osmotic lysis)
去污剂裂解 (Detergent lysis, SDS)
酶裂解 (Enzymatic lysis,溶菌酶, 纤维素酶, 果胶酶, 溶细胞
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