5-蛋白功能.pptVIP

蛋白的功能1---结合（binding) 特异的分子识别对于蛋白功能是至关重要的。 结合的配基可以是小分子（氧分子）或生物大分子（DNA－TATA box)。 特异性结合的基础是分子形状的互补和极性相互作用（氢键等)。 蛋白功能3---分子开关（molecular switch） 蛋白质分子具有柔性，当配基结合或PH环境发生改变时，蛋白质的分子构象会发生变化。这种改变可以用作控制细胞功能的分子开关。 Ras蛋白：GTP结合构象可以起始细胞生长的信号传导过程。 核蛋白体的组装 大肠杆菌核蛋白体的空间结构为一椭圆球体，其30S亚基呈哑铃状，50S亚基带有三角，中间凹陷形成空穴，将30S小亚基抱住，两亚基的结合面为蛋白质生物合成的场所。 Normal versus degenerating neuron AD是由β淀粉样蛋白（Aβ）的沉积物引发的，最初它是淀粉前体蛋白（APP）的一部份，APP可跨越神经细胞的细胞膜。Aβ多肽是由APP分子释放出来的，具有2种特定的酶β-secretase和γ-secretase。 许多亚细胞结构具有动态特征: 一些结构蛋白形成暂时的结构,当不再需要时这些结构即被破坏. 异常蛋白沉积可以导致细胞和组织结构和功能损伤 阿尔茨海默病（AD） 原发性性痴呆症，表现进行性认知、记忆功能障碍。 发病率： AD占老年痴呆70%，65y为5%，95y＞90% 病理： (1) 细胞外淀粉样蛋白沉积：与淀粉样蛋白前体（APP）变异 和改变有关。 (2) 神经元内纤维缠结（NFT） 解剖基础：脑萎缩（海马和前脑基底部神经元脱失） beta-amyloid protein Amyloid plaque: 淀粉样蛋白斑 老年斑（SP） Ras-MAPK signal transduction pathway 两种G蛋白的活性型和非活性型的互变 是一类和GTP或GDP相结合、位于细胞膜胞浆面的外周蛋白，由?、?、? 三个亚基组成。 有两种构象：非活化型；活化型 蛋白功能4----结构蛋白： 某些蛋白参与构成生物体的结构成分，这种功能依赖于蛋白亚基之间或与其他蛋白，糖基等分子之间特异结合，从而使复杂体系进行自我组装。 结构蛋白也是丝绸，胶原，角蛋白等生物材料的主要成分。 蚕丝的主要成分是丝心蛋白，而丝心蛋白的主要二级结构是反平行排列的?-折叠。丝心蛋白的一级结构含有长的重复序列片段，-Gly-Ser-Gly-Ala-Gly-Ala-。Gly侧链氢位于折叠平面的一侧，而Ala和Ser的甲基侧链和羟甲基侧链位于折叠平面的另一侧，堆积的折叠片靠侧链之间的van der Waals力结合在一起。 第三章 蛋白质的功能 2-1 功能的结构基础 ?功能多样性的基础是源于组成氨基酸侧链的化学多样性,多肽链本身的柔性和不同多肽链折叠的多样性. 第三章 蛋白质的功能 2-2 柔性(flexibility)与蛋白功能的关系 四级结构的柔性允许蛋白结构适应配基分子的结构 钥匙与锁(lock-and-key analogy )（空间匹配） 诱导契合(induced fits) 蛋白激酶A（蓝色）与一个肽类底物类似物（桔色）的滑动配合（snug fit)，产生的基础是两个分子共同的结构调整适应。 蛋白构象改变的过程，就是蛋白对形成三级结构的作用力和与新配基形成的相互作用力之间平衡的变化作出的反应性变化。 艾滋病治疗药物的作用基础是药物与病毒蛋白酶活性位点的结合和对蛋白酶活性的抑制。 HIV 蛋白酶抑制剂：(a)(b)分别为haloperidol(氟哌啶醇),crixivan，(c)为天然底物的多肽类似物，三者虽然结构不同，但都可以与活性位点结合，诱导活性位点上方结构的封闭，发生酶与天然底物结合时发生的结构改变。 第三章 蛋白质的功能 2-3 结合位点的部位和特性(Location and Nature of Binding Sites) ?蛋白表面与生物大分子的结合位点可以是凹陷的,凸出的或平面的. 黄色：生长激素；桔色和绿色：（相同的受体分子。 显示界面处分子间的紧密契合。 a:白喉毒素基因阻遏蛋白与tox启动子区DNA序列之间结合形成的复合物结构。阻遏子蛋白是同源二聚体，两个亚基与启动子序列结合，DNA序列的大沟部位被螺旋－转角－螺旋结构中的一个螺旋识别。 b:真核Gal4转录因子与DNA形成的复合体的结构。相互作用发生在DNA大沟部位，识别位点为一簇被锌离子稳定的环结构。 第二章 蛋白质的功能 2-3结合位点的部位和特性 ?Bi