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2018-05-19 发布于贵州
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摘要：本文档简要介绍在曙光HPC集群上部署WRF/ARPS气象模式时软件环境的准备及模式安装的方法步骤。曙光集群基础软件环境操作系统所有节点统一安装Red Hat Enterprise Linux Server release 6.2 64位操作系统编译器要求安装GNU、Intel、PGI三套编译器。默认情况下，推荐使用Intel编译器，运行效率较高。GNU编译器编译器类型编译器命令版本安装路径C编译器gcc4.4.6/usr/bin/gccC++编译器g++4.4.6/usr/bin/g++Fortran 77编译器gfortran4.4.6/usr/bin/gfortranFortran 90编译器gfortran4.4.6/usr/bin/gfortran备注：GNU编译器为Red Hat Linux系统自带。Intel编译器编译器类型编译器命令版本安装路径C编译器icc12.1.0/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/bin/intel64/iccC++编译器icpc12.1.0/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/bin/intel64/icpcFortran 77编译器ifort12.1.0/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/bin/intel64/ifortFortran 90编译器ifort12.1.0/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/bin/intel64/ifortIntel编译器环境变量脚本：/public/software/profile.d/intel-env.shPGI编译器编译器类型编译器命令版本安装路径C编译器pgcc10.2/public/software/pgi/linux86-64/10.2/bin/pgccC++编译器pgCC10.2/public/software/pgi/linux86-64/10.2/bin/pgCCFortran 77编译器pgf7710.2/public/software/pgi/linux86-64/10.2/bin/pgf77Fortran 90编译器pgf9010.2/public/software/pgi/linux86-64/10.2/bin/pgf90PGI编译器环境变量脚本：/public/software/profile.d/pgi-env.shMPI并行环境mvapich2MVAPICH2是基于MPICH2的一个MPI拓展实现，提供了对IB，iWARP，RcCE，PSM，uDAPL等新型高性能通信设备和协议的支持，同时也支持TCP/IP协议和共享内存，还支持Nvidia GPU并行任务。MVAPICH2支持的通信接口（10种）如下图所示：MVAPICH2由美国俄亥俄大学开发，最新版本已到MVAPICH2 1.9+，基于MPICH2-1.5+开发，支持MPI-1和MPI2.2标准，并已初步支持MPI-3标准。官方网站为：/overview/mvapich2//overview/mvapich2/。Intel编译器版本(默认MPI)版本：mvapich2-1.8安装路径：/public/software/mpi/mvapich2-18-intel环境变量脚本：/public/software/profile.d/mvapich2-intel-env.shMPI编译器：编译器类型编译器命令安装路径C编译器mpicc/public/software/mpi/mvapich2-18-intel/bin/mpiccC++编译器mpicxx/public/software/mpi/mvapich2-18-intel/bin/mpicxxFortran 77编译器mpif77/public/software/mpi/mvapich2-18-intel/bin/mpif77Fortran 90编译器mpif90/public/software/mpi/mvapich2-18-intel/bin/mpif90MPI运行方式：#mpirun –f hostfile –n 32 ./mpi_exec其中hostfile格式如下：node1:16node2:16从源码安装mvapich2方法：#tar zxvf mvapich2-1.8.tar.gz#cd mvapich2-1.8#./configure --prefix=/public/software/mpi/mvapich2-18-intel --with-de