invitrogenTRIzol提取RNA和DNA简要中文说明.doc

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invitrogenTRIzol提取RNA和DNA简要中文说明

TRIzol提取RNA和DNA简要中文说明 内容来自于invitrogen的15596-026的说明书翻译改动而来NA的分离 准备试剂:TRIzol氯仿100%异丙醇%乙醇无RNase的水handy pestle 操作步骤:RNA操作在冰上进行1、每50~100mg组织加入1ml TRIzol ,handy pestle匀浆RNALater保存的组织,(其实组织50mg提出的RNA大大富余) 2、将匀浆样品在室温(15~30℃)放置5分钟,使核酸蛋白复合物完全分离。 3、每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿,用手剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。 5、4℃12,000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的约50%。 6、用200ul的枪2枪把水相转移到新管中(样本足够因此少抽以防止DNA污染)。 7、1mlTRIzol加入0.5ml100%异丙醇,颠倒混匀,室温放置10分钟。 8、4℃12,000×g离心10分钟,移去上清,之后可以看到RNA沉淀。 9、1ml TRIzol至少加1ml 80%乙醇。(-20°放一年) 10、vortex混匀,4℃下7500×g离心5分钟,弃上清,也可见沉淀。 11、室温放置干燥RNA沉淀,大约5~10分钟即可.加入无RNase的水(乳腺癌100mg样本加50ul浓度大约为2ug/ul),用枪头吸打几次,稍微离心,55~60℃放置10分钟使RNA溶解。可-80℃保存一段时间,最好马上逆转录。 12、260比280是1.8-2.1(低可能是污染,也可能测时候的问题)产量公式:260×稀释倍数×40=ug/ml DNA的分离准备试剂:乙醇0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇) 75%乙醇8mM NaOH 操作步骤: 样品加氯仿分层后,移去上层水相, 1mlTRIzol加0.3ml无水乙醇混匀,颠倒混匀,室温放置3分钟 4℃2000×g离心5分钟。 去上清,用含10%乙醇的0.1M柠檬酸钠洗涤DNA沉淀。每用1mlTRIzol加入1ml柠檬酸钠,室温放置30分钟, 4℃2000×g离心5分钟,弃上清 (大于200ug的DNA重复一次1-3步骤)。 1ml TRIzol加入1.~2 ml75%乙醇,室温放置10~20分钟不时颠倒混合4℃2000×g离心5分钟, 弃上清。 室温放置晾干DNA 5~15分钟,用8mM NaOH 300l8mMNaOH溶解从1mg组织可能1-4ugDNA。溶解DNA后可用HEPES调节pH。 、DNA中可能包含一些胶状不溶物可>1000×g离心10分钟除去。 将溶液放入新管中。注意事项:   预期产量:1mg组织或1×106细胞提取RNA分别为:   肝和脾6~10μg ,肾3~4μg ,骨骼肌和脑组织1~1.5μg ,胎盘1~4μg ,上皮细胞8~15μg ,成纤维细胞5~7μg 。DNA的定量:取一份溶于8mMNaOH的DNA加水测A260值。一单位A260值相当于50μg/ml双链DNA。根据DNA产量可估计细胞数,人、大鼠、小鼠1×106二倍体细胞含DNA的量分别为7.1μg,6.5μg,5.8μg。 预期产量:1mg组织或1×106细胞提取DNA分别为肝和肾3~4μg 骨骼肌,脑组织,胎盘2~3μg 人,大鼠,小鼠培养细胞(1×106)5~7μg 成纤维细胞5~7μg。 应用:   1.用于PCR 溶于8mM NaOH的DNA用0.1M HEPES调pH至8.4,取0.1~1μg DNA用作模板。   2.酶切反应用HEPES或1mM EDTA调节pH至适当值。每μg DNA使用3~5单位的酶,80~90%的DNA是可消化的。   1ml 8mM NaOH溶解的DNA样品pH值调节   Final pH 0.1M HEPES(μl) Final pH 1M HEPES(μl)   8.4 86 7.2 23   8.2 93 7.0 32   8.0 101   7.8 117   7.5 159 注意事项:   1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8保存过夜。   2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8可保存几个月。   3.DNA在8mM NaOH溶液中4可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4或-20长期保存。常见问题分析: 得率低:   A.样品匀浆和裂解的不彻底。   B.最终得到的DNA沉淀没有完全溶解。 A260/A280<1.70 :   A. 检测吸光度时,RNA样品没有溶于水,而溶于了TE中。   B.酚除去的不彻底,可用0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)再洗一遍DNA沉淀。 DNA降

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