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- 2018-05-07 发布于河北
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Blast软件及常用数据库介绍——faneds
blast软件及常用数据库介绍 BLAST软件及常用数据库介绍 制作人:faneds BLAST的概述: Blast,全称Basic Local Alignment Search Tool,即“基于局部比对算法的搜索工具” ,能够实现比较两段核酸或者蛋白序列之间的同源性的功能,具有较快的比对速度和较高的比对精度,适用于多种序列比对的情况,在常规双序列比对分析中应用最为广泛。 BLAST的种类 Blastp :蛋白序列与蛋白库做比对,直接比对蛋白序列的同源性。 Blastx:核酸序列对蛋白库的比对,先将核酸序列翻译成蛋白序列,再与蛋白库做比对。 Blastn:核酸序列对核酸库的比对,直接比较核酸序列的同源性。 Tblastn:蛋白序列对核酸库的比对,将库中的核酸序列翻译成蛋白序列,比对蛋白序列的同源性。 Tblastx:核酸序列对核酸库在蛋白级别的比对,将库和待查序列都翻译成蛋白序列,然后对蛋白序。 * * Blast是一个集成的程序包,通过调用不同的比对程序,blast实现了五种可能的序列比对方式 BLAST资源 NCBI主站点: /BLAST/ (网络版) /blast/
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