03生物信息传递(上)-2008-3-23_PPT课件.ppt

附：RNA拼接的意义 RNA拼接现象的发现，给生物学家一系列令人困惑的疑问：为什么生物机体要先转录内含子，然后将其切除？RNA合成后再拼接是一个非常耗能的过程，对细胞其收益是什么？内含子由何而来？内含子有无生物功能？ 围绕以上问题，提出一些看法或观点，但争议很大，目前尚无定论： ●RNA的拼接是生物机体在进化历史中形成的，是进化的结果； ●RNA的拼接是基因表达的重要环节。RNA转录后通过拼接而抽取有用信息，形成连续的编码序列，并可通过选择性拼接而控制生物机体生长发育。因此，这是真核生物遗传信息精确调节和控制的方式之一。 ●基因由模块装配而成，模块间的间隔序列也就演变成内含子，因此外显子和内含子有着同样的古老历史。而现今存在的几类内含子也各自有其起源和进化历史，从它们的拼接方式和分布可以大致推测其起源时间。 ●RNA的拼接主要存在于真核生物，原核生物极为少见，但并非完全没有。一种合理的解释是原核生物为适应快速生长的需要，在进化中已将内含子丢掉。事实上，快速生长的单细胞如酵母，其编码的基因也几乎没有内含子。然而内含子的存在和拼接作用对生物机体的进化十分重要。 ●内含子和外显子是相对的，有些内含子具有编码序列，能产生蛋白质和功能RNA。如Ⅰ型内含子能产生核酸内切酶，Ⅱ型内含子能产生核酸内切酶和逆转录酶。以帮助内含子的转移。 五、RNA的编辑、RNA的再编码、 RNA的化学修饰和核酶 1、RNA的编辑 （１）定义 　　编辑（editing）是指转录后的RNA在编码区发生碱基的突变、添加或缺失等现象。 C变为U （2）编辑机制： ①碱基的突变 转录因子 转录复合体 TBP TAFs TFIIA TFIIB TFIIF Pol II TFIIE RNA pol Ⅱ的转录起始 ● 真核生物转录起始复合物 三、转录的基本过程（以大肠杆菌为例） 1、起始位点的识别： 　　　RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。 2、转录起始 RNA链上第一个核甘酸键的产生 3、RNA链的延伸 ● ?亚基脱落，RNA–pol聚合酶核心酶变构，与模板结合松弛，沿着DNA模板前移； ●在核心酶作用下，NTP不断聚合，RNA链不断延长。 核心酶 ···· DNA ···· RNA 4、转录终止 终止子（terminator，t） ●强终止子－内部终止子（不依赖Rho (ρ)因子的　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　转录终止。） ●弱终止子 －需要ρ因子（rho factor） 又称为ρ依赖性终止子 （Rho-dependent terminator） （１）强终止子－－不依赖?因子的终止 ①终止位点上游一般存在一个富含GC碱基的二重对称区，RNA形成发夹结构； 　②在终止位点前面有一段由4-8个A组成的序列，RNA的3’端为寡聚U。 发夹式结构和寡聚U的共同作用使RNA从三元复合物中解离出来。 终止效率与二重对称序列和寡聚U的长短有关，长度 效率 （２）弱终止子－－依赖?因子的终止 ?因子：六聚体蛋白、水解各种核甘三磷酸促使新生RNA链从三元转录复合物中解离出来，从而终止转录。 转录的基本过程 5、转录产物： 经转录生成的RNA有多种，主要的是rRNA，tRNA，mRNA，snRNA 和 hnRNA。 6、转录的抑制剂 （1）RNA生物合成的抑制剂（之一）：模板抑制剂 ①烷化剂：使DNA发生烷基化，发生在G-N7，A-N1、N3 N7 ；C-N1。易引起嘌呤的水解，在DNA上留下空隙干扰复制或转录；或引起碱基错配。 ②放线菌素D：放线菌素D与DNA形成非共价的复合物 ，抑制其模板功能（低浓度抑制转录，较高浓度抑制复制）。具有类似作用的还有色霉素A3 、橄榄霉素、光神霉素。 ③嵌入染料：可插入双链DNA分子相邻的碱基对之间，一般具有芳香族发色团。溴化乙锭（EB）是一种高灵敏的荧光试剂，常用来检测DNA和RNA。与DNA结合后抑制其复制和转录。 （2）RNA生物合成的抑制剂（之二）： NH2 OH N F NH2 SH NH2 NH2 作为代谢拮抗物抑制合成酶类或直接掺到核酸分子中，形成异常RNA或DNA。 （3）RNA 聚合酶抑制剂（之三）：RNA聚合酶抑制剂 ①利福霉素：抑制细菌RNA聚合酶活性。利福平可以高效抑制结核杆菌，杀死麻疯杆菌，在体外有抗病毒作用。 ②利链霉素：与细菌RNA聚合酶?亚