10章 微生物的分类鉴定.pptVIP

第十章 微生物的分类鉴定 分类学的3大任务 本章内容 第一节 通用分类单元 一、种以上的分类单元 二、种及种以下的分类单元 二、种及种以下的分类单元 三、学名的命名规则 1、俗名和学名 2、种的命名——双名法 3、亚种的命名 第二节 微生物在生物界的地位 一、生物的界级分类学说 两界系统 三界系统 四界系统 五界系统 六界系统 三总界五界系统 二、三域学说及其发展 第三节 微生物分类鉴定的方法 分类鉴定方法 一、经典方法 二、现代方法 1、氨基酸顺序和蛋白质分析 2、DNA的碱基组成（G+Cmol%） 3、核酸的分子杂交 4、rRNA的寡核苷酸编目分析 优点 三、伯杰氏手册 小 结 随后他又对包括某些真核生物在内的大量菌株进行了16SrRNA（18SrRNA）序列的分析比较，又发现极端嗜盐菌和极端嗜热嗜酸菌也和甲烷细菌一样，具有即不同于其它细菌也不同于真核生物的序列特征，而他们之间则具有很多共同的序列特征。 于是提出将生物分为三个界（后来称三个域，或叫原界）：古细菌、真细菌和真核生物。1990年，他为了避免把古细菌也看作是细菌的一类，又把三个域改称为：细菌、古生菌和真核生物。 敏感 敏感 不敏感 核糖体对白喉毒素 罕见 有 有 质粒 一般有 无（仅一个例外） 一般有 二羟尿嘧啶 有 有 无 mRNA的帽化和聚A尾 无 有 有 操纵子 蛋氨酸 蛋氨酸 甲酰蛋氨酸 起始tRNA 80S 70S 70S 核糖体 由酯键连接 由醚键连接 由酯键连接 质膜结构 无 无 有 细胞壁中肽聚糖 有 无 无 核膜 真核生物 古生菌 细菌 比较项目 古生菌作为当今仍生活在地球上某些极端环境的一个特殊群体，其特殊的生境与地球生命起源初期的环境有许多相似之处。因此，三域学说的建立和发展，对进一步探讨生命的起源与进化，进一步研究和开发微生物资源提出了新的思路。 鉴于微生物形体微小、结构较简单等特点，微生物分类和鉴定除了像高等生物那样，采用传统的形态学、生理学和生态学特征之外，还必须寻找新的特征作为分类鉴定的依据。 一、经典方法 二、现代方法 三、伯杰氏手册 经典鉴定指标 形态：个体、群体 生理生化反应：营养要求、酶等 生态特征：生长温度、pH等 生活史，有性生殖情况 血清学反应 对噬菌体的敏感性 其他 1、氨基酸顺序和蛋白质分析 2、DNA的碱基组成（G+Cmol%）3、核酸的分子杂交4、rRNA的寡核苷酸编目分析 蛋白质的氨基酸顺序 mRNA顺序 编码基因 因此，可以通过对某些同源蛋白质氨基酸序列的比较来分析不同生物系统发育关系，序列相似性越高，其亲缘关系愈近。 一般来说，蛋白质氨基酸顺序的进化速率大体上是恒定的，但功能不同的蛋白质常以不同的速率进化。功能重要的分子序列或序列区域往往进化变化速率低。 在研究中必须根据所比较的类群选择适当的分子。 细胞色素和其他电子传递蛋白 组蛋白 热休克蛋白 转录和翻译的蛋白 许多代谢酶 （G+C）mol％＝ G+C A+T+G+C ×100％ 这是目前发表任何微生物新种时所必须具有的重要指标。 原因 亲缘关系相近的种，其基因组的核苷酸序列相近，故两者的GC比也相近。 GC比差距很大的两种微生物，他们的亲缘关系必然较远。 GC比是建立新分类单元的可靠依据。种内2.5％～4％，5%不同种，10％不同属。 按碱基的互补配对原理，用人工方法对两条不同来源的单链核酸进行复性，以构建新的杂合双链核酸的技术，称为核酸杂交。 DNA-DNA DNA-RNA RNA-RNA 一般认为，DNA-DNA杂交同源性超过60％的菌株可以是同种，同源性超过70％者是同一亚种，而同源性在20％～60％范围内时，则属于同一个属。 通过分析原核细胞或真核细胞中最稳定的rRNA寡核苷酸序列同源性程度，以确定不同生物间的亲缘关系和进化谱系的方法。 * * 微生物分类学：研究微生物分类理论和技术方法的学科。 分类 鉴定 命名 根据一定的原则对微生物进行分群归类。分类的原则：亲缘关系和进化规律。 根据现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定微生物所应归属的分类群的过程。 为微生物确定一个学名。 第一节 通用分类单元 第二节 微生物在生物界的地位 第三节 微生物分类鉴定的方法 小结 一、种以上的分类单元 二、种及种以下的分类单元 三、学名的命名规则 界 门 纲 目 科 属 种 一个或多个种构成一属，一个或多个属构成一科，依此类推。必要时，还可在