第一章蛋白质结构基础 第三节.pptVIP

三、三类主要结构 α型结构 β型结构 α/β型结构 1、 α型结构(αstructure) 这类蛋白质主要由α螺旋组成，其螺旋含量一般在60％以上，有的高达80％。α螺旋在这类蛋白质中大多以反平行方式排布和堆积，所以又称反平行α结构。 按照螺旋排布的不同拓扑学特征，又可分为一些亚组。肌红蛋白、血红蛋白、烟草花叶外壳蛋白、细胞色素b，等均属此类结构。 α型结构(αstructure) (1) 线绕式α螺旋(coiled-coil α helix)：纤维蛋白的结构基础，有足够强度和柔性 (2) 四螺旋束 (four helix bundle) (3) 珠状折叠(globin fold)：血红蛋白 (4) 复杂螺旋组合 2、 β型结构(β structure) 此类结构主要由反平行β层构成。β型结构在大小和组织上都有很大的变异范围，但在大多数情况下反平行β层都缠绕成一柱状或圆桶状，在桶内有一个由侧链构成的疏水核心 丝氨酸属水解酶、免疫球蛋白A、一些球状RNA病毒的外壳蛋白等均属此类 分 类 上一下桶式(up-and-down βbarrel)和 开放 式折叠(up-and-down open βsheet) 希腊钥匙(回纹)式折叠(Greek key β barrel) β螺旋折叠(parallel β-helix fold) 3.α/β型结构 特征：以平行的或混合的β层为中心四周围绕α螺旋 以β-α-β模体组成 尽管随着用于统计分析的数据基础不同，这些比例数字也会有所变化，但是都表明这三类结构包含了已知蛋白质的绝大部分。 上列前三类结构所占的比例分别是20％(α型)、32％(β型)、35％(α/β型)。 第三节 多肽链的生物合成与折叠 蛋白质是具有高度组织、结构极复杂的生物大分子 了解这种复杂蛋白质结构的形成机理，对于以设计和构建新型蛋白质为目标的蛋白质工程的战略性考虑和具体途径选取，都有十分重要的意义 一、多肽链的生物合成 自然界中的蛋白质可以由几十个氨基酸组成，也可以由上千个氨基酸组成 按化学标准，蛋白质的共价结构是极其巨大和复杂的，但它仍可在有机体内被精确地制造 有机体中所有相同的蛋白质分子都有同样的一级结构，所有不同的蛋白质分子都具有不相同的一级结构。这是由于有一个精确的生物合成机理，严格控制着作为蛋白质一级结构主要基础的多肽链的生成 多肽链生物合成的主要环节 基因携带规定氨基酸序列的核苷酸三联体遗传密码 双链DNA分子的遗传信息转录到单链信使RNA(mRNA) mRNA在核糖上的翻译 蛋白质剪接 1990年在啤酒酵母ATP酶中发现第一个蛋白质内含肽。在已发现的近百种蛋白质内含肽中，其大小均在134-608个氨基酸之间 典型的蛋白质剪接的结构特点 (1)在蛋白质编码序列的一定位置具有插入序列，而其同源蛋白则不存在 (2)蛋白质内含肽的Ｎ末端有保守的Cys或Ser残基,而蛋白质外显肽在剪接处则具有Cys，Ser或Thr残基 (3)蛋白质内含肽的Ｃ末端具有特征性短序列，如：His-Asn N末端的100-150个氨基酸残基和C末端的50个氨基酸残基组成蛋白质剪接域 中间的200-250个氨基酸残基具有引导核酸内切酶活性 二、多肽链的折叠——蛋白质三维结构的形成 蛋白质折叠（protein folding ):从体内新生的多肽链或体外变性的多肽链的一维线性氨基酸序列转化为具有特征三维结构的活性天然蛋白质的过程 生理意义：这种三维结构的破坏，该蛋白质的功能活性也就丧失 熔球态 (melton globule) 折叠中间体：在蛋白质从变性态折叠成天然态的过程中，通常要经历若干个中间的分子构象状态，即蛋白折叠中间体，也叫做部分折叠态。它们通常具有部分天然蛋白的结构，相对分子量相同，是分子构象不同的同一种蛋白质。折叠中间体可以是平衡态中间体，也可以是动力学中间体。 熔球态是折叠的中间体，疏水侧链内埋是重要驱动力，在折叠途径中第一个可观测的中间体是柔性无序的未折叠多肽链卷折成局部有组织的球状态，称为熔球体(melton globule) 熔球体的形成是一个快速过程，只需几毫秒，目前对之了解甚少。但对于熔球体的特性已有一些了解 折叠机理认识 氨基酸顺序与蛋白质三维结构之间的对应关系称之为“第二遗传密码”或“折叠密码”。 对多肽链的折叠机理，至今尚缺乏本质性和规律性的认识。因此，尽管目前对于蛋白质的序列知识已有了丰厚的积累，对蛋白质的复杂结构已有了深入的了解，但至今还不知道能将二者直接联系起来的规律。这使得在目前从氨基酸序列去构建期望的蛋白质结构还只能是个案研究课题，也是通过蛋白质工程设计和制造新蛋白质的基础性困难。 维系蛋白质结构及蛋白质折叠的动力 维系和稳定蛋白质三维结构