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第一章 Internet 基础与生物医学文献检索 第一节 Internet 基础 第二节 Internet网上生物医学文献检索 2、PubMed的一般检索方法 检索时的心理活动 第一阶段 希望检索的内容要全面 第二阶段 希望检索的内容要精炼 PubMed 检索窗口 图1-9 PubMed主题词浏览器 2) 作者途径检索（Author） 3）文献来源期刊途径检索（Title） PubMed 期刊浏览器 4）截词检索（Truncation） 利用文献作者途径检索PubMed时，其作者名字的输入格式应为姓在前、名在后。作者姓用全称，作者名用名字首字母缩写形式，而且不用标点。如：“Smith JA”、“Crawford SC”。PubMed具有自动截词功能以解决名字的不同缩写和名称解释，如：Jr、2nd等。利用以上形式输入的作者姓名，将在PubMed作者字段中检索。如果只输入文献作者的姓，则PubMed不仅在作者字段中查询，而且也在所有其它字段中查询，除非作者姓可在MeSH转换表中找到。这时的作者姓将作为MeSH或自由词进行检索。例如：输入作者姓“Yang”后，PubMed将以“ Yang[MeSH] OR Yang[Text Word]” 形式检索。 MEDLINE数据库引用作者信息的原则在不同时期也不尽相同，用户在以文献作者途径查询PubMed时需注意。 ¨?????? 1966-1984年: MEDLINE不限制作者人数。 ¨?????? 1984-1995年：NLM将文献作者人数限制在10人，超出10人的，从第11位作者起以“et al”代替。 ¨?????? 1996-1999年：NLM将作者人数限制增加到25人，超出25人的，第26位起以“et al”代替。 ¨?????? 2000年以后：NLM列出文献的全部作者。 PubMed允许利用刊名检索特定期刊发表的文献。刊名既可以是刊名全称，如：Molecular biology of the Cell,也可以是MEDLINE刊名标准缩写, 如：Mol biol cell。也可以通过国际标准连续出版物代码（ISSN）查询期刊，如：1059-1524。当期刊刊名词同时也是MeSH时，如：Gene Therapy、Cell等，PubMed 将这些未限定的词作为MeSH来检索。要想将这些词限定在刊名字段检索，需在刊名后加上刊名标识符“[ta]”，如：“Gene therapy[ta]”。此外，如果刊名为一个单词时，将其作为检索词检索时也应利用刊名标识符“[ta]”加以限定。否则，PubMed将在所有字段中搜索该单词。 例如：查询“Contraception”时，以不同途径进行检索可以获得不同的检索结果。限定在刊名字段“Contraception[ta]”检索可获得3758条文献，未加限定即作为自由词“contraception”检索可获得34617篇文献。输入parasite检索到47261篇，输入parasite[ta] 检索到586篇。 利用ISSN途径检索可查询到绝大多数期刊，但个别老刊可能因为没有ISSN而查询不到。以刊名途径检索时，刊名中带有括号的可将括号省略不输，如：“J Hand Surg [Am]”可以应用“J Hand Surg Am[ta]”检索式检索。 查询PubMed系统中的具体刊名可通过PubMed 的“期刊浏览器（Journal Browser）”实现。通过点击PubMed主页左侧的“Journal Browser”进入刊名检索界面。 * * 生物信息学是一门新兴的并正在迅速发展的交叉学科，是生命科学和信息科学尤其是分子生物学与计算机信息处理技术相结合而形成的交叉学科，是采用数学、统计学和计算机方法对生物学数据信息进行采集、存储、传播、分析、归类、解释的科学。该学科涉及生物学、计算机科学、数学、统计学、医学、化学等众多学科不同研究方向的研究人员，其共同点在于任何类别的数据皆依赖于计算机处理、存储、分析。Internet网络是信息传输、检索、获取、交流的重要手段。因此，Internet的应用是生物信息学研究的关键。 Internet不是单一的计算机网络，而是建立在计算机网络之上的网络，是通过同一组计算机网络通信协议-即TCP/IP（Internet Control Protocol/Internet Protocol）将许多计算机局域网连接起来形成的巨型计算机网络。国内对Internet的称谓有很多，如：因特网、国际互联网、交互网等。因特网从20世纪60年代末诞生到80年代网络的基本形成，目前已经发展为连接世界上170多个国家的国际性网络。作为一种新的信息传播媒体，因特网以其信息量大、数据更新迅速、文件传输速度快、使用方法简便等诸