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第七章 线粒体DNA多态性 学习目的 1 了解mtDNA的结构与功能 、线粒体基因组; 2 掌握mtDNA多态性 、mtDNA单核苷酸多态性 、 mtDNA的串联重复序列多态性 、mtDNA单倍群; 3 了解mtDNA分型命名 、 mtDNA分析技术 (法医mtDNA分型 、人类线粒体全基因组DNA分析 ); 4 掌握mtDNA分型的特殊问题 。 前言 线粒体DNA 惟一的细胞核外DNA,携带有编码蛋白质和RNA的基因 结构:双链16569bp, 其中一条为重连,一条 为轻连。基因编码物 各不相同。 基因中不含非编码序列, 多数情况下,几乎不 含终止密码。 转录与翻译均在线粒体中进行。 DNA不与组蛋白结合 部分密码子不同于核基 因组密码子。 特征(1)碱基结构紧凑、简洁:以最少碱基数编码尽量多的蛋白质和RNA ? 基因间无间隔序列 ? 基因内无内含子、前导序列、带帽序列和终止信号 ? 相邻基因甚至有碱基的重叠 (2)不存在同源基因间的重组与交换 结果:mtDNA所有序列变异呈单倍型特性 功能:储存信息---编码参与氧化磷酸化蛋白质和RNA的基因 H 链:2个rRNA,14个tRNA,12个蛋白质 L 链:8个rRNA,1个蛋白质 自身复制---单向复制:置换环复制或D-环(D-loop)复制 特点:不对称的复制, H链和L链各有一个复制起点,先复制H链, H链复制到达L链起始点后,L链开始复制 D-环:新合成第三条H链姊妹链 ,序列与L链互补 H链复制起点附近( 520-700 ),高变异 转录功能--两条链同时转录合成RNA--对称转录 阈值效应(threshold effects) 对于异质性的mtDNA突变,细胞可以承受正常的mtDNA减少直到一个阈值时细胞才调亡或细胞的功能受损。 mtDNA突变所产生的效应取决于该细胞中野生型和突变型线粒体DNA的比例,只有突变型DNA达到一定数量(阈值)才足以引起细胞的功能障碍,这种现象称为阈值效应。 阈值效应的一个表现就是在某些线粒体遗传病的家系中,有些个体起初并没有临床症状,但随年龄增加由于自发突变、环境选择等原因,突变型DNA逐渐积累,线粒体的能量代谢功能持续性下降,最终出现临床症状。 mtDNA突变可以影响线粒体功能,引起ATP合成障碍,导致疾病发生,但实际上基因型和表现型的关系并非如此简单。突变型mtDNA的表达受细胞中线粒体的异质性水平以及组织器官维持正常功能所需的最低能量影响,可产生不同的外显率和表现度。 瓶颈效应: 卵细胞中有100000左右拷贝的mtDNA,在受精卵形成时,只有数个拷贝卵细胞的mtDNA进入到受精卵,这个现象称为瓶颈效应。 因此异质性的母亲的孩子通常会有平均水平不同的异质性突变。可以解释在一些线粒体遗传病具有很高的家族间临床变异性。 细胞分裂时,突变型和野生型mtDNA发生分离,随机地分配到子细胞中,使子细胞拥有不同比例的突变型mtDNA分子。 在连续的分裂过程中,异质性细胞中突变型mtDNA和野生型mtDNA的比例会发生漂变,向同质性的方向发展。 表型的高度多态(polymorphism) mtDNA突变所产生的表型极为多态。在一个家系中,患病个体的表现可以完全不同;有的以血管病变为主,如中风、冠心病等;有的表现为不同程度的肌无力;有的以精神症状为主;有的以眼科疾病为突出表现。发病的年龄差异也很大。 突变率比较高 主要分布 控制区(D-环区)- 含有启动子和重链复制的起点 跨距约1100bp,个体间存在较大差异 高 变 区 HV-I 29 ~ 408号碱基 HV-II 15996 ~ 16401号碱基 HV-III 438 ~ 574号碱基 主要原因 A : mtDNA没有组蛋白的保护 B : DNA聚合酶缺乏3’-5’外切酶校正功能 C : 缺乏DNA损伤的修复体系
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