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基因工程LH
基因工程的目的:
采用DNA重组技术从不同生物基因组中优良性状相关的基因克隆,转移同一生物基因组中,培育出具有高度应用价值的新物种。
目的基因:
优良性状相关的基因,即用于克隆的基因。
目的基因包括:
蛋白(酶)基因、抗逆性相关基因、生物药和保健品相关基因、毒物讲解相关的基因等。
结构基因组成
1.原核生物的基因组成
(1)基因区:操纵子形式存在,但各基因分别有
ATG的起始密码子和TAA(TAG、TGA)的终止密码子。
(2)启动区:RNApol识别、结合和开始转录的一
段DNA核苷酸序列。
(4)转录终止子和终止因子
转录终止子:一个基因或一个操纵子3′端,提供转录停止信号的DNA核苷酸序列。
终止因子:协助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子的蛋白。
(1)质粒的基因:少量结构基因、基因组成简单,启动子、
编码区和终止子,无内含子。
(2)病毒的基因:多顺反子、重叠基因、有的基因含有内含
子。
(3)线粒体的基因:能源代谢相关的基因、多顺反子、动物
Mt基因没有内含子,而植物Mt基因含有
内含子,有的没有。
(4)叶绿体的基因:光合作用相关的基因,多顺反子形式进
行转录,具有原核生物相似的启动子。
5.1.2 基因的排列
基因组的每个基因一般一个一个直线排列在DNA分子上,并且两个基因之间存在非编码的间隔序列,但存在一些特殊排列。
1.重 叠 基 因
核苷酸序列彼此重叠的基因,即不同基因共用同一段DNA的核苷酸序列,他们的核苷酸序列彼此重叠。
2.重复基因(repeated gene or duplicated gene)
原核生物基因组 — 单拷贝基因
真核生物基因组 — 约30%的基因是多拷贝
3. 加倍基因
高等生物:2n = 两套基因组
原核生物: n = 一套基因组
蓝 藻: 多倍性染色体,存在多套基因,不易获得基因突变体
4. 基 因 重 排
有的基因组中,同一基因簇处在不同细胞中时,基因排列会发生变化。
5.2 目的基因的制备
分离的基因:有功能的基因:启动区、编码区和终止区
操纵子:启动子、功能相关的编码基因和终止子
编码区:只分离ORF
promoter or terminator
目的基因的制备方法
直接分离法
构建基因文库分离法
聚合酶链式反应PCR分离法
化学合成法
1.直接分离法
一、限制性核酸内切酶酶切分离法
1.对已知序列的DNA分子;
2.对已知定位的目的基因;
3.对未知序列未知定位的基因。
二、基因分离的物理化学法
该方法是基因工程发展初期所用的方法。根据不同基因片段碱基组成不同,理化性质(沉降系数、解链温度)的差异采用相应的方法分离目的基因,但目前已很少采用。
(1)密度梯度离心法
其原理是GC含量高DNA片段的浮力密度较高,而富含AT的 DNA片段的浮力密度低,利用密度梯度超速离心技术可以分离GC含量较高的目的基因片段。
(2)单链酶解法
(3)分子杂交法(Molecular hybridization)
ssDNA与其互补的核苷酸序列配对形成dsDNA,这就是分子杂交的原理。
三、双抗体免疫法分离编码蛋白的基因(真核)
条件:纯化目的基因的天然蛋白、制备抗天然蛋白的抗体。
四、利用酶促反转录法分离基因
主要用于合成分子质量较大,转录产物mRNA易分离目的基因。
5.2.2 构建基因组文库的的分离法
DNA文库—具有扩增能力的各种DNA片段的混合体。
如果文库的容量足够大,就能包含该物种或该组织
全部DNA或RNA(以cDNA的形式)的序列。
基因组文库—由于基因组文库来自于某一物种的基因组,而该物种所有组织中的基因组均相同,所以基因组文库具有种属特异性,但无组织特异性。文库—cDNA文库来自于某一物种某种组织的RNA,所以cDNA文库既有种属特异性,也有组织特异性。
1.
含有某种生物全部遗传信息的重组DNA分子的克隆总和
2.基因组文库的大小
理论值:
基因组文库的克隆数目=基因组DNA总长/DNA插入片段的平均长度。
3. 建立基因组文库的一般程序
1.载体DNA片段的制备
DNA分离纯化 → 限制酶切 → 脱磷酸化反应
2. 供体DNA片段的制备
总DNA分离纯化→ 机械剪切法→ 分离特定大小DNA片段
超声波~300bp,剧烈搅拌:~8Kb
酶法 部分酶切 分离特定大小
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