植物DNA条形码应用于大样地群落学研究-中国森林生物多样性监测.PDFVIP

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2018-05-20 发布于天津
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植物DNA条形码应用于大样地群落学研究-中国森林生物多样性监测.PDF

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植物DNA条形码应用于大样地群落学研究-中国森林生物多样性监测

第七届海峡两岸森林动态样区研讨会植物DNA条形码应用于大样地群落学研究裴男才，陈步峰，李健容中国林科院热带林业研究所国家林业局珠江三角洲森林生态系统定位研究站 10/22/2013，温州 1 提纲 • DNA条形码简介 • DNA条形码在大样地中的应用  保存生物资源  鉴别植物物种  构建群落系统发育关系  揭示群落系统发育结构  评估生物多样性指数 • 讨论 2 DNA条形码（Barcode ） • 主要理念：通过获取生物组织中一段短的 DNA序列，快速而准确地在物种水平上进行分类和鉴定的技术 3 Hebert et al., 2003, 2004 条形码片段位置 rbcL, coding gene, low evolution rate matK, coding gene, fast evolution rate trnH-psbA , non-coding spacer region, fast evolution rate Slide from John Kress 叶绿体DNA 4 研究机构 • 国际生命条形码联盟（Consortium for the Barcode of Life ）是全球生物DNA条形码研究的协调机构，在欧美、亚太等主要生物多样性研究地区设有节点或分支，涵盖50 多个国家和地区的200多个组织和机构。 Consortium for the Barcode of Life, / 5 应用1：保存生物资源 The International Barcode of Life Project (iBOL): activated in October 2010. Its first phase (2010-2015): 5M specimens, 500K species. 截止到2013年6月30 日 Sequences: 117,184 Specimens: 116,552 6 应用2 ：鉴别植物物种 • 弥补分类学家之不足 • 常用搜索工具：BLASTn ；TaxonDNA 7 Altschul et al., 1997; Meier et al., 2006 CTFS network • Center for Tropical Forest Science (/) • ~ 48 Plots, 22 Countries, 4.5 Million Trees, 8500 Species 8