维真生物-变形梯度凝胶电泳.docxVIP

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  • 2018-05-17 发布于福建
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变性梯度凝胶电泳实验原理DNA 双链分子在全长不断增加温度或用化学变性剂条件处理下,两条链就会开始分开(即解链)。首先解链的区域由解链温度较低的碱基组成。GC碱基对比AT碱基对结合得要牢固,因此GC含量高的区域具有较高的解链温度。同时影响解链温度的因素还有相邻碱基间的吸引力。解链温度低的区域,通常位于端部称作低温解链区。如果端部分开,那么双螺旋就由未解链部分束在一起,这一区域便称作高温解链 (图1) 。图1如果温度或变性剂浓度继续升高,两条链就会完全分开。变性梯度凝胶电泳法依据首要的一点是:DNA双链末端一旦解链,其在凝胶中的电泳速度将会极剧下降。第二个根据是,如果某一区域首先解链,而与其仅有一个碱基之差的另一条链就会有不同的解链温度,其电泳速度也会有明显差别。因此,将样品加入含有变性剂梯度的凝胶进行电泳就可将二者分开(图 2, 1 和 2 道)。图2最终,如果一双链在其低温解链区碱基错配(异源双链),而与另一等同的双链相比差别仅在于此,那么,含有错配碱基的双链将在低得多的变性剂浓度下解链。事实上,样品通常含有突变、正常的同源双链以及配对的异源双链,后者是在PCR扩增加时产行的。而含有错配的双链(图2中的3和4道)通常可以远远地与两个同源双链(图2中1和2道)分开,这种分离效果使该方法灵敏度很高。为使仅有一个碱基之差的不同分子取得最好的分离效果,必须先选择所要研究的DNA范围以及电

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