基于并行计算策略的dotdft图像重建先进方法-advanced do tdft image reconstruction method based on parallel computing strategy.docx

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基于并行计算策略的dotdft图像重建先进方法-advanced do tdft image reconstruction method based on parallel computing strategy

独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作和取得的 研究成果,除了文中特别加以标注和致谢之处外,论文中不包含其他人已经发表 或撰写过的研究成果,也不包含为获得 天津大学 或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中 作了明确的说明并表示了谢意。学位论文作者签名:签字日期:年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解 天津大学有关保留、使用学位论文的规定。 特授权 天津大学 可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检 索,并采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编以供查阅和借阅。同意学校向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘。(保密的学位论文在解密后适用本授权说明)学位论文作者签名:导师签名:签字日期:年月日签字日期:年月日中文摘要光学成像技术(如扩散光学层析(DOT)与扩散荧光层析(DFT)),因其 在灵敏度、特异性及安全性上具有的综合优势,已发展为传统医学影像方法在获 取功能和分子水平生物信息上的有效补充手段。然而,目前的 DOT/DFT 技术在 处理复杂结构组织的准确光子输运模型、大尺寸组织体的光学参数精细重建和全 时间分辨数据的有效应用等问题上存在较大缺陷。本文致力于寻求上述问题基于 并行计算策略的先进解决方法,提高 DOT/DFT 图像重建的质量。首先发展了一套任意复杂组织体中基于 GPU 加速的光子输运 MC 模型,以准确描述生物体中的高吸收、低散射和空腔等复杂光学特性。在此正向模型基础 上,提出对应的稳态 DOT 和时域 DFT 图像重建方法。模拟与实验结果表明,此 方法可比扩散方程获得更准确的组织体生理和病理信息。搭建了一套稳态 DFT-DOT 联合断层成像系统:系统采用基于光开关切换的 串-并混合门控光子计数检测模式,可有效实现测量时间、灵敏度和系统性价比 之间的平衡。在面向乳腺组织的应用上,采用了高对比度 DFT“导航”血氧 DOT 的图像重建策略,并以高速 MC 模型为正向计算,有效改善了单独血氧 DOT 重 建的不适定性。基于并行全区域分解策略和 CPU-GPU 联合加速的 Schwarz 迭代框架,解决 了大尺寸和三维组织 DOT 图像重建过程中,正逆向算子不断线性迭代带来计算 时间和存储量上的负担。模拟和实验结果验证了本模型在改善重建质量、计算时 间和存储空间方面的有效性。为充分发挥时域 DFT 重建的优势,提出一种利用全时间分辨模式下辐射率 的傅里叶序列近似和 CPU-GPU 联合加速多频域扩散方程的策略求取时域 DFT 的近似解法。模拟和实验结果表明,所提出的方法可获得较好的重建图像,计算 资源也远小于有限差分法。论文通过 Monte-Carlo 光子输运建模、CPU 多核并行和 GPU 多线程并行等 先进方法,提高了 DOT 和 DFT 技术对生物组织体的重建效果。通过 MC 模拟器、 自行搭建的稳态光子计数型 DOT/DFT 实验系统及实验室已搭建的时间相关单光 子计数系统的模拟和实验结果表明,上述方法在图像重建的时间、准确度和分辨 率上有各自对应的优化效果。关键词:扩散光学层析;扩散荧光层析;Monte-Carlo 模拟; GPU 加速;全时 间分辨测量ABSTRACTThe optical imaging technique (such as diffuse optical tomography (DOT) and diffuse fluorescence tomography (DFT)) has been developed as an effective supplementary method in reporting the functional and molecular biological imformations, with comprehensive advantage of sensitivity, specificity and security. However, present DOT/DFT techniques meet up with severe defects in accurately modeling of photon propagation in complex structures, precisely reconstruction of optical parameters in large-sized tissues, and effectively use of full time-resoved measurements. The main purpose of this thesis is to find applicable advance

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