2017年第五章-多序列比较实际应用.pptxVIP

多序列比较的实际应用主讲教师：赵雨杰多序列比较的实际应用多序列比较就是把两条以上可能有系统进化关系的序列进行比较的方法。目前对多序列比较的研究还在不断前进中，现有的大多数算法都基于渐进比较的思想，在序列两两比较的基础上逐步优化多序列比较的结果。进行多序列比较后可以对比较结果进行进一步处理，尤其是在寻找基因和致力于发现新蛋白的努力中，人们习惯于把新的序列同已知功能的蛋白序列作比较。在搜集的比较序列中，可以看出隐含于蛋白之中的物种进化关系，以便于更好地理解蛋白的进化。研究一个家族中的相关蛋白的差异，分析进化压力和生物秩序对于功能相关的蛋白进化影响。研究完多序列比较中的高度保守区域，我们可以对蛋白质的整个结构进行预测，并且猜测这些保守区域对于维持三维结构的重要性。 分析一群相关蛋白质时，很有必要了解比较正确的构成。发展用于多序列比较的程序是一个很有活力的研究领域，绝大多数方法都是基于渐进比较（progressive alignment）的概念。渐进比较的思想依赖于使用者用作比较的序列之间确实存在的生物学上的或者更准确地说是系统发生学上的相互关联。 与数据库检索的关系1、对数据库搜索，检索结果未知；2、数据库检索后寻找到一组相似序列；3、构建进化树。CLUSTAL主讲教师：赵雨杰1. CLUSTAL OmegaCLUSTAL 算法是一个最广泛使用的多序列比较程序，在任何主要的计算机平台上都