人类基因组中的假基因课件.pptVIP

三、线粒体假基因的特点 五、假基因存在的意义 * 第八章 人类基因组中的假基因 第一节 核基因组中的假基因 1977年，Jacq等人在研究5S rRNA基因时发现了第一个假基因(pseudogene, ψG)。 他们在非洲爪蟾DNA中克隆了一个5S rRNA基因相似序列，与功能基因相比，这段序列的5’端有16bp的缺失和另外14bp的错配，将这段5 S rRNA基因相似序列称为假基因。 一、假基因（pseudogene）的发现 人的5S rRNA基因有2000个拷贝,并且在染色体上串连排列； 非洲爪蟾的5S rRNA基因的一个重复单位含有一个5S rRNA基因、一个不转录的假基因(101bp的5S rRNA基因的片段),每个重复单位间被不转录的间隔序列隔开,间隔序列的长度变化不定,最长达400bp。 G·Jacp在对非洲爪赡5SrRNA基因簇的研究后发现ψG核苷酸序列同其相应的正常功能基因基本相同，但却不能合成出功能蛋白质的失活基因。 生物演化上的痕迹 二、假基因类似人的痕迹器官 现已在大多数真核生物中发现了假基因，如Hb的假基因、干扰素、组蛋白、α球蛋白和β球蛋白、肌动蛋白及人的rRNA和tRNA基因均含有假基因。由于假基因不工作或无效工作，故有人认为假基因，相当人的痕迹器官，或作为后补基因。 脊椎动物中的β－珠蛋白基因族和假基因 假基因（pseudogene）定义:基因组内，结构上与编码某一蛋白质的结构基因相似，在进化过程中获得突变而丧失了产生蛋白产物能力的序列片段，这类基因称为假基因。 为了表示假基因与结构基因的对应关系,假基因的命名是在结构基因后加一个P表示: 如： actin beta pseudogene ACTB-P 或者：ΨACTB 假基因的表示方法 三、假基因的分类与特点 根据形成机制分为两种类型 （1） 非加工假基因(non-processed pseudogene)也叫复制型假基因(duplicated pseudogene) （2 ）加工假基因（processed pseudogene）或返座假基因（retropseudogene） 复制型假基因：往往保留了功能基因的外显子－内含子结构，有时这种结构是不完整的。 加工假基因的结构特点： （1）不同部位有不同程度的缺失或插入突变，常常形成移码及终止密码子； （2）缺少正常基因的内含子和启动子； （3）3’端都有真核生物mRNA分子特有的AATAAA信号，造成转录启动区的缺陷； （4）两侧有正向重复序列。 四、假基因的数量 五、人类基因组中假基因的分布 （2004年） 六、小鼠基因组中假基因的分布 第二节 线粒体假基因 哺乳动物线粒体基因组(mtDNA)由37个基因和一段长度可变的非编码序列(又称控制区或D-loop)组成。37个基因中包括13个蛋白质基因，2个rRNA基因和22个tRNA基因。其中，13个蛋白质基因分别是细胞素C氧化酶三个亚基Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(COⅠ、COⅡ和COⅢ)，细胞色素b基因 (Cytb)、ATP合成酶亚基ATPase6和ATPase8 和NADH脱氢酶七个亚基的基因NDl，ND2，ND3，ND4，ND4L，ND5，ND6。 一、线粒体基因组简介 动物mtDNA 基因组全序列结构示意图 哺乳动物mtDNA的37个基因都以相同的相对位置排列(仅 在有袋类和鸟类中有微小变化)； 基因排列得十分紧凑，无重复、无内含子和转座因子，也没有基因间隔区(即使有也很短，仅1至数个核苷酸)，有些基因部分序列重叠； 动物mtDNA中长度可变的非编码区是mtDNA复制及转录的起点及控制区； 尽管不同家畜的mtDNA大小稍有差异，但基因的数量和功能却相似； 家畜mtDNA的基因排列相当经济，两个 rRNA基因相邻，基因中没有内含子，22个tRNA的基因位于rRNA和13个蛋白质基因之间。 1967年由DuBuy和Riley两位学者发现用提纯的小鼠mtDNA和核DNA进行杂交，发现两者的结合能力很强，推断核基因组中存在mtDNA的同源序列。 直到1994年，Lopez等用southem杂交的方法在家猫核基因组中发现了长为7.946kb的线粒体基因组同源序列。发现这种序列是不能表达的假基因，并以nuclear mitochondrial DNA Segments (Numts)指代这种核基因组中存在的线粒体假基因。 二、线粒体假基因 (1) 核基因组中的Numts 片段已经涵盖了线粒体基因组的全部基因。其中细胞色素b（Cytb）、调控区(D-loop)、细胞色素氧化酶C亚基1(COⅠ)的插入频率较高。 (2) Numts序列长短不一，短的有39bp，长的则几乎相当于整个线粒体基因组