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禾本科hd-zip i转录因子基因家族的分子进化研究-molecular evolution of hd - zip i transcription factor gene family in gramineae.docx

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禾本科hd-zip i转录因子基因家族的分子进化研究-molecular evolution of hd - zip i transcription factor gene family in gramineae

evolution of Oryza sativa HD-Zip I gene family were coupling with proposed whole genome duplication events, HD-Zip I genome segments have extensive microsynteny between species. These results can serve as an important basis for resolving molecular evolution of the HD-Zip I gene family on the genome-wide level and identifying genes which have functions in stress response.Keywords: Comparative genomics, Microsynteny, HD-Zip I gene family, GrassesIII目录摘要 ............................................................................................................................IAbstract ....................................................................................................................... II目录 ......................................................................................................................... IV1. 文献综述 .................................................................................................................. 11.1 基于全基因组测序的基因家族发掘 ............................................................. 11.1.1 植物基因组的测序................................................................................ 11.1.2 基因家族及对基因家族成员的鉴定.................................................... 11.2 基因家族系统发育分析 ................................................................................. 11.3 禾本科比较基因组学研究进展 ..................................................................... 21.3.1 基因组的倍增........................................................................................ 21.3.2 比较遗传图谱........................................................................................ 21.3.3 微共线性................................................................................................ 41.4 选择压力对基因家族进化的影响 ................................................................. 41.4.1 分子进化速率........................................................................................ 41.4.2 基因家族分子进化保守性.................................................................... 51.5

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