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博奥晶典科研服务产品介绍 北京博奥晶典生物技术有限公司 博奥生物集团有限公司 生物芯片北京国家工程研究中心 Contents 目录 目 录 Contents 4 科学发现 基因组学 蛋白质组学 转录组学 转录 反转录 翻译 SNP检测 CNV检测 靶向测序 mRNA检测 miRNA检测 lncRNA检测 蛋 白芯片 表观遗传检测 高通量测序平台 博奥 √ √ √ √ √ √ √ √ Illumina √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ Thermo √ √ √ √ √ √ √ √ 高通量 芯片/质谱筛选平台 博奥 √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ Affy √ √ √ √ √ √ Illumina √ √ √ √ Agilent √ √ √ √ 验证平台 博奥 √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ 3730XL √ √ √ √ √ √ √ √ 7900HT √ √ √ √ √ Sequenom √ √ 抗体制备 蛋 白质组学 微生物鉴定 DArT技术 可变剪切检测 代谢组学 代谢 小分子检测 CNV: Copy Number Variation; DArT:Diversity Array Technology circRNA检测 打造最完善高通量分子检测平台 5 6 产品划分 按照检测内容和平台划分: 近40项 7 新产品/平台 8 近100项 目 录 Contents --- SNP检测技术 --- CNV检测技术 --- 甲基化检测技术 --- 捕获测序技术 DNA水平-SNP检测 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性 高密度 功能性 遗传稳定性 易于检测 …… 10 11 基于SNP标记的高中低通量检测平台 12 检测样本(test)和对照(reference)基因组间的DNA拷贝数变异 (copy number variation) Deletion 缺失 DNA拷贝数变异(CNV) 13 14 CNV检测产品 公司 产品 Agilent CGH芯片 人,小鼠,大鼠,牛,犬鸡,黑猩猩,水稻,恒河猴 Affy SNP6.0,OncoScan,CytoScan Capitalbio 家蚕,大肠杆菌,白色念珠菌,酵母 ABI Taqman CNV检测 目标区域测序 vs. 全基因组测序 外显子组指基因组所有的外显子,是基因组中1%的功 能最相关的区域,是许多突变的集中区域。 OR 15 16  通量 测序平台 原理 测序长度 数据量/实验 耗时/实验 中低通量,PCR-reseq ABI 3730XL Sanger法 1000bp 96kb 2小时 中高通量, PCR-reseq SeqCap Solexa/Illumina 可逆性链终止合成测序 2*100bp 100-600G 11天 Ion Torrent 半导体芯片测序 200-400bp 1G 2小时 靶向测序解决方案 PCR-reseq:PCR产物重测序 SeqCap:序列捕获,可以针对100k-96M连续的或非连续的靶标区域进行检测 可根据靶标区域大小、位点数目、样品数目等 选择合适的检测平台! 17 人外显子捕获产品比较 客户只需提出想法,提供样品,即可拿到实验结果 博奥将全程参与,为您提供全面优质的服务,以及高效专业的技术支持! Roche/Agilent(eArray) 负责探针设计、探针合成 捕获测序实验以及数据分析由博奥负责完成 18 定制捕获服务流程 为什么要进行表观遗传和染色质结构研究? 调控重要的生物过程 表观遗传改变 染色质修饰 调控 基因 表达 肿瘤 (其他疾病) 发育 分化 DNA 甲基化 异常突变 PNAS (2008) Nature Genetics (2009) PLOS One (2010) 甲基化 …… 19 20 甲基化检测平台产品 Illumina 人850K芯片 全基因组甲基化测序 MeDIP-Seq ChIP-Seq Sequenom技术 21 临床科研---新热点 新方向 肠道菌群 22 人类肠道微生物群落 23 癌症 炎症型肠道病 肥胖 腹泻 II型糖尿病 慢性病 肠道菌研究热潮 24 25 肠道菌和疾病 26 肠道微生物样本 提取基因组DNA 16sRNA基因扩增 Ion Torrent测序 生物信息数据分析 肠道微生物样本 提取基因组DNA 鸟枪法 建库 MiSeq PE测序 生物信息数据分析 16s r

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