20份野生狗牙根srap体系优化及多态性的分析.docVIP

20 份新疆野生狗牙根 SRAP 体系优化及多态性分析 张延辉，阿不来提，李培英，张艳霞 （新疆草地资源与生态自治区重点实验室，新疆农业大学草业与环境科学学院，新疆乌鲁木齐 830052） 摘要：通过探讨狗牙根 SRAP 反应体系中主要因子对扩增结果的影响，建立了狗 牙根 SRAP-PCR 反应的最适宜体系：在 10ul 的反应体系中，1.4μL 10×Buffer ， dNTP 浓度为 0.2mmol/L，TaqDNA 聚合酶 0.2U 及 DNA 模板为 20ng。利用 SRAP 标 记技术对新疆 20 份野生狗牙根材料的遗传多样性进行研究。结果表明：供试材 料野生狗牙根具有较为丰富的遗传多样性；各生态地理类群间的遗传分化与其所 处的生态地理环境具有一定的相关性。 关键词：狗牙根；SRAP；聚类分析 The SRAP System Optimization and Polymorphism Analysis of 20 Wild Cynodon dactylon from Xinjiang Zhang Yanhui，Abulti，Lipeiying，Zhangyanxia (Xinjiang Key Laboratory of Grassland Resources and Ecology, Department of Grassland and Environment Science, Xinjiang Agriculture University , Urumqi，830052) Abstract: An optimum SRAP-PCR system was established by Studying the effection on the major elements of SRAP reaction system of Cynodon dactylon, The results showed that the best concentration was 1.4μL 10×Buffer,0.2 mmol/L dNTP,0.2 U Taq DNA enzyme, template DNA 20ng/μL , primer 25 ng/μL in 20μL reaction system. Sequence-related amplified polymorphism(SRAP)molecular markers were used to detect the genetic diversity of 20 wild accessions of Cynodon dactylon collected from Xinjiang. The results showed that there is rich genetic diversity among the wild resources of Cynodon dactylon tested. As well as showed that a correlation between genetic differentiation and eco-geographical habits among the groups. Key words: Cynodon dactylon; SRAP; Cluster analysis 狗牙根属(Cynodon dactylon L.)植物属于禾本科(Gramineae)虎尾草亚科 [9] 的南部、非洲、欧洲、亚洲的南部各国分布，为世界广种。在我国，狗牙根主要 [1] [2] 对狗牙根 SRAP(Sequence-related amplified polymorphism, SRAP)-PCR 体系进 [3] 份野生狗牙根野生狗牙根进行 SRAP 分子标记技术研究, 认为野生狗牙根具有较 为丰富的遗传多样性。新疆境内野生狗牙根资源丰富，地域环境差异大，在水平 和垂直地带都有一些特殊的生境，而这些特殊生境都有野生狗牙根零星分布，而 且形态表现差异较大。目前，针对新疆狗牙根的形态研究工作基本已经完成，但 还没有从分子水平深入探究该种的遗传变异，所以研究其遗传多样性就显得尤为 必要。 本研究拟通过建立 SRAP-PCR 反应体系并对其进行优化,以探索新型分子标 记技术 SRAP 在狗牙根遗传多样性研究中应用的可行性。本研究将为狗牙根基因 图谱的构建、分子标记的研究提供理论基础。 1 材料与方法 1.1 材料 2008 年 5 月将由新疆各地采集的野生狗牙根材料种植于新疆农业大学试验 场原始资料圃内，小区面积 1m×2.5 m，小区间距 70 cm，期间进行灌溉、杂草 防除等田间管理工作。狗牙根材料编号及来源见表 1。 表 1