微生物基因组学知识.pptVIP

;一、概述;3、微生物基因组学的主要研究内容 ⑴从研究工作的内容而言 ①结构基因组学 ②功能基因组学 ③比较基因组学;二、微生物基因组的序列测定 ㈠测序目的 研究基因组的前提和基础。 ㈡测序策略 1.应根据待测序列的长度、要求测序的精确度和现有的条件来制定测序策略。 2.测序类型分为两类:①确认性测序 ②从头测序 ;大规模基因组测序的几个支撑技术;;Sanger 双脱氧末端终止法测序原理;自动化测序;第一代测序技术：Sanger等发明的双脱氧核苷酸末端终止法和Gilbert等发明的化学降解法。;美国X奖基金会2006年10月4日宣布设立一项金额高达1000万美元的奖金，激励科学家“多快好省”地绘制出人类基因图谱。 规则：在30天内以高精确度测序100个百岁老人基因组样本，并覆盖98%的基因组，每个基因组的测序费用控制在1000美元或以下。;㈢微生物基因组测序的策略 1.随机测序法 即不考虑方向性，随机对靶DNA进行测序，最后采用计算机拼装而得到完整的序列信息。该方法又包括两种方法。 ⑴鸟枪法 它包含有三种消化法 ①限制性内切酶消化法②超声波处理法③胰DNA酶消化法;⑵人工转座子法 转座子是具有跳跃功能的DNA元件，是细菌或酵母染色体上的特定基因区，利用转座酶可使转座子随机插入靶DNA。 优点： ①一次体外反应即可形成大量转座子的插入。 ②可以在其上加入更有利于DNA测序（