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第13章 RNA生物合成PPT
二、真核生物的转录 转录起始点上游-25bp区段多数有共同的TATA序列,称为Hogness盒或TATA盒。 不同物种、不同细胞、不同的基因,可以有不同的上游DNA序列,但都可统称为顺式作用元件(cis-acting element)。 (一)转录起始 1.转录起始点的上游序列(upstream squences) 与基因表达调控有关的DNA非编码序列,统称为顺式作用元件。 真正转录终止点 GCGC-CAAT-TATA..ATG AATAAA 修饰点 外显子 内含子 翻译起始 转录起始 TATA盒(Hogness box) CAAT盒 GC盒 增强子 切离加尾 真核生物RNA pol Ⅱ转录的基因 翻译终止 能直接或间接辨认、结合顺式作用元件,从而调节基因表达的一类蛋白质因子。 反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶的蛋白质因子。 2.反式作用因子(trans-acting factor) 转录因子(transcriptional factor, TF) 参与RNA-pol Ⅱ转录的TFⅡ 转录因子 功 能 TFⅡA 稳定TF ⅡD-DNA复合物 TFⅡB 促进pol Ⅱ结合 TFⅡD TBP 结合TATA盒 TAF 辅助TBP-DNA结合 TFⅡE ATPase TFⅡF 解螺旋酶 TFⅡH 蛋白激酶活性,使CTD磷酸化 TAF:TBP associated factors TBP 辅因子 TBP:TATA binding protein TATA结合蛋白 3. 转录起始前复合物 (pre-initiation complex, PIC) 真核生物RNA-pol不与DNA分子直接结合,而需依靠众多的转录因子。 ⅡA ⅡB 由RNA-Pol Ⅱ催化转录的PIC POL-Ⅱ TFⅡF ⅡH ⅡE TBP TAF TFⅡD-ⅡA-ⅡB-DNA复合物 TATA POL-Ⅱ TFⅡF ⅡH ⅡE CTD- P PIC组装完成,TFⅡH使CTD磷酸化 ⅡA ⅡB TBP TAF TATA 拼板理论(piecing theory) 一个真核生物基因的转录需要3至5个转录因子。转录因子之间不同方案组合,生成有活性、专一性的复合物,再与RNA聚合酶搭配而有针对性地结合、转录相应的基因。 按不同组合,人类约3.5万个基因,估计需转录因子300余个即可。 (二)转录延长 *polⅡ大亚基CTD被TFⅡH磷酸化才能离开起动子区域并进入延长阶段。 *真核生物转录延长过程与原核生物大致相似,但没有转录与翻译同步的现象。 * RNA-pol前移处处都遇上核小体。 *转录延长过程中随RNA pol前移,可以观察到核小体移位或解聚现象。 转录延长中的核小体移位和解聚 RNA-Pol 核小体 转录方向 移位 RNA-Pol RNA-Pol 解聚及弯曲 (三)真核生物的转录终止 AAUAAA GUGUGUG AATAAA GTGTGT 3′processing (核酸内切酶) —AAUAAA—Poly(A) Nuclease Helicase hnRNA 5’ Release 转录终止修饰点 pause pol II (一)真核生物mRNA的剪接 1. hnRNA (heterogeneous nuclear RNA) 富含U 不均一核RNA,核内未被剪接的有内含子的mRNA前体。 2. snRNA (small nuclear RNA) 种类:U1,U2,U3,U4,U5,U6等。 几个重要概念 第三节 RNA的转录后加工 一、真核生物新生mRNA的剪接和修饰 核内小RNA snRNP(小分子核糖核蛋白体) (RNA剪接的场所) 核内蛋白质 snRNA 4. 断裂基因(split gene) 真核生物的结构基因中,外显子被内含子间隔开,但连续镶嵌,为一个连续完整的蛋白质编码。这种基因称为断裂基因。 3. 外显子(exon)和内含子(intron) 真核生物结构基因中的编码序列,称为外显子,非编码序列称为内含子。 S Pre B C A 成熟的mRNA 5 ′— —3′ S Pre B C C A hnRNA 胰岛素基因 断裂基因的概念 内含子的分类 根据基因的类型和剪接的方式,通常把内含子分为4类。 I:主要存在于线粒体、叶绿体及某些低等真核生物的 rRNA基因; II:也发现于线粒体、叶绿体,转录产物是mRNA; III:是常见的形成套索结构后剪接,大多数mRNA基因有此类内含子; IV:是tRNA基因及其初级转录产物中的内含子,
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