第五章 生物信息传递PPT.pptVIP

第五章 生物信息的传递--从DNA到RNA;基本概念 转录的基本过程 转录机器的主要成分 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 终止和抗终止 内含子的剪接、编辑、再编码及化学修饰; 现代分子生物学的最基本原理： 基因作为惟一能够自主复制、永久存在的单位，其生物功能是以蛋白质的形式表达出来的。所以，DNA序列是遗传信息的贮存者，它通过自主复制得到永存，并通过转录生成信使RNA、翻译生成蛋白的过程来控制生命现象。; 基因表达包括转录和翻译两个阶段。 转录是指拷贝出一条与DNA链序列完全相同（T/U）的RNA单链的过程，是基因表达的核心。 翻译是指以新生的mRNA为模板，把核苷酸三联体密码子翻译成氨基酸序列、合成多肽链的过程，是基因表达的最终目的。;一、基本概念;参与转录的物质;参与原核细胞RNA复制的酶类及有关因子; 真核细胞RNA聚合酶的性质与大肠杆菌RNA聚合酶相似。真核细胞中转录速度很快，在37℃时RNA链的延伸可达2500个核苷酸/分。 ;转录的不对称性：;模板链并非永远在同一条单链上;二、参与转录起始的关键酶与元件;大肠杆菌RNA聚合酶的组成分析;真核生物RNA聚合酶 P71;RNA聚合酶与DNA聚合酶的区别;（二） 启动子(promoter); 原核生物启动子结构; ; ;大肠杆菌RNA聚合酶全酶所识别的启动子区;;真核生物启动子;Promoters contain different combinations of TATA boxes, CAAT boxes, GC boxes, and other elements. ;Upstream transcription factors bind to sequence elements that are common to mammalian RNA polymerase II promoters. ;真核生物启动子的结构;1、核心启动子;2、上游启动子元件;增强子及其功能 P78 增强子：一类可促进起始的序列，处于上游或下游区离起始点很远的地方，这类序列所组成的元件称为增强子。 增强子特点： ① 增强效应十分明显，一般能使基因转录频率增加10-200倍② 增强效应与其位置和取向无关，不论增强子以什么方向排列（5’→3’或3 ’→5’），甚至和靶基因相距3 kb，或在靶基因下游，均表现出增强效应； ③大多为重复序列，一般长约50bp，适合与某些蛋白因子结合。其内部常含有一个核心序列：（G）TGGA/TA/TA/T（G），该序列是产生增强效应时所必需的； ;④ 增强效应有严密的组织和细胞特异性，说明增强子只有与特定的蛋白质（转录因子）相互作用才能发挥其功能；; 转录起始复合物 P73;;三、转录的基本过程; 启动子是DNA分子可以与RNA聚合酶特异结合的部位，也就是使转录开始的部位。在基因表达的调控中，转录的起始是个关键。常常某个基因是否应当表达决定于在特定的启动子的起始过程。 DNA链上从启动子直到终止子为止的长度称为一个转录单位。一个转录单位可以包括一个基因，也可以包括几个基因。; 启动子选择阶段聚合酶全酶对启动子的识别：聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭复合物（closed complex）。伴随着DNA构象的变化，封闭复合物变成开放复合物（open complex），聚合酶全酶所结合的DNA序列中有一小段双链被解开。开放复合物与最初的两个NTP相结合并在这两个核苷酸之间形成磷酸二酯键后即转变成包括RNA聚合酶、DNA和新生RNA的三元复合物。 ; 一般情况下，该复合物可以进入两条不同的反应途径：一是合成并释放2~9个核苷酸的短RNA转录产物，即所谓的流产式起始；二是尽快释放?亚基，转录起始复合物通过上游启动子区并生成由核心酶、DNA和新生RNA所组成的转录延伸复合物。 启动子的识别要靠?因子来完成。;3、RNA链的延伸; RNA链的延伸阶段开始后，σ因子即从核心酶-DNA-新生RNA复合体上解离下来，并可再用于和新的核心酶结合。 一般认为，σ因子被解离是因为此时它已不起作用了，或是因为σ因子的存在会造成RNA聚合酶与启动子序列结合过紧，以致不能沿着模板移动。所以当新生链-酶复合体与DNA模板的结合很弱，并且酶亦不再要求与特异序列的DNA结合时，链的延伸才能达到最佳状态。; RNA聚合酶起始基因转录后，它就会沿着模板5’—3’方向不断移动，合成RNA链，直到碰上终止信号时才与模板DNA相脱离并释放新生RNA链。终止发生时，所有参与形成RNA-DNA杂合体的氢键