水稻根系在低磷胁迫下基因表达谱外文翻译.docVIP

水稻根系在低磷胁迫下基因表达谱外文翻译.doc

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水稻根系在低磷胁迫下基因表达谱外文翻译

植物分子生物(2010)72:423-432 DOI 10.1007/s11103-009-9580-0 水稻根系在低磷胁迫下的基因表达谱 李立华 李超 连星明 接收:2009年9月1日/接收:2009年11月16日/在线发表:2009年11月21日 摘要 磷(P),植物中一种重要的大量营养素,是一些重要分部分,如核酸、磷脂和ATP。因为可溶性磷能够直接被植物所吸收,所以磷常被看作是作物产量潜力的一种限制性营养物质。为应对磷缺乏,植物已经进化出了一系列的分子和形态的适应。然而,这些对磷缺乏反应的分子学基础还没有彻底被阐明。在这篇报告中,将低磷耐性的水稻中早18(亚洲栽培稻,印度籼稻)和不具低磷耐性Lagrue(亚洲栽培稻,印度籼稻)的根分别在低磷胁迫条件下处理6小时、24小时和72小时在低磷胁迫,调查探究它们的基因表达分析,并和对照组(正常的磷条件下)进行比较。含60000个低聚糖(70碱基对)DNA芯片的使用显示了水稻基因组的所有假定的基因。低磷耐性的水稻中早18(亚洲栽培稻,印度籼稻)和不具低磷耐性Lagrue(亚洲栽培稻,印度籼稻)的根分别在三个时间点做低磷处理,分别有1518个和2358个基因的改变显现出来。这些差异性表达基因包括:那些参与磷酸盐(Pi)运输,运输系统的基因(除了磷转运蛋白、磷酸酶),除了磷酸酶、初级代谢、二次新陈代谢等等。对水稻中早18的根做低磷处理,发现有几个参与糖酵解和柠檬酸循环的基因在早期阶段期间上调,而水稻Lagrue根却没有这样的变化。 这些结果可以能能够为进一步研究植物对帝林条件的适应的分子机制提供有用的信息,从而促进作物品种的磷利用率的改善的研究。 关键词:磷 表达式分析谱 水稻 DNA芯片 介绍 磷是土壤中一种难利用难得到的大量要素,它经常性的限制植物生长(万斯等人 ,2003)。次优水平的P可以导致减产5--15%。由于这些原因,需要给农作物提供无机磷化肥。 为应对应无机磷的供应不足,植物已经形成了高度专业化的生理和生化代谢以从环境中获取和利用这种无机化学物质。植物根系统在它们形成过程中具有高度可塑性,并可以适应他们的架构。低磷可用性支持主根系生长中的横向根系生长。通过增加递减的横向根密度和长度,细胞长度的减少导致主根系生长的降低(威廉姆森. 2001)。在植物磷缺乏情况下,有机酸(立顿,1987;格雷厄森,1992)和磷酸酶(鲍德温,2001)产生和排泄出来,以从无机物质中调动磷物质。核糖核酸酶能够从内部RNA库中调动磷物质,在磷缺乏的条件下它的产生量也增加了(多兹,1996)。此外,在磷缺乏植物中,一个能够编码高度亲和力的磷转运蛋白基因的表达也增加了。促进磷获取的旁路途径在P饥饿植物中也被激活了 (达夫,1989)。 尽管和控制磷匮乏的感知、信号传送和相关联基因的激活这样相关的分子机制的细节,还没有被阐明出来,但是,在最近的研究中已经表明了一些有趣的线索。通过包括驱使β-葡萄糖醛酸梅表达的一个启动子的系列突变,β-葡萄糖醛酶通过磷的丧失被上调,PHR1,在拟南芥中鉴别出来一种Myb类转录因子,现在已经发现了拟南芥PHR1和一个完全不完整的回文序列绑定。这种回文序列也在饥饿诱导基因的很多启动子区域中存在。作为编码PHR1基因的表达,PHR1对磷缺乏不是很相应。显然,它在低磷信号传导中是在后阶段的。SIZ1,一个小的泛素类似物修饰E3连接酶,他对于PHR1的激活起了一个短暂的作用,这影响了一些被转因子激活的一些基因的表达。MiR33的表达是受磷缺乏诱导的,他也是在RHR1控制之下。在营养充足的条件下,MIR399的过表达导致磷积累的增加。它也把一个泛素连接E2酶UBC24的mRNA当做目标,并且相互作用控制PHO2的表达。另一个保守结构域SPX,它是在酵母SYG1和PHO81的N末端中被发现的。最近,已经表明在低磷的信号通路中,人类XPR1蛋白起着重要的作用。 微阵列是分析植物在不同发育和环境条件下的基因表达分析的一种很实用的工具。最近,关于应对病原体、非生物胁迫、低氮、低磷的植物响应的基因表达图谱的几项成功的研究已经被报道。在这篇论文中,我们应用6000个低聚糖的微阵列,这6000个低聚糖代表了所有的水稻基因(从北京基因研究所购买)的假定的基因,以此来分析用常规磷条件作为一个对照组,在低磷胁迫下,水稻中早18(低磷耐性)和Lagrue(不具低磷耐性)根部基因表达图谱。 材料和方式 植物栽培和样本制备 水稻中早18(亚洲栽培籼稻,印度)是具低磷耐性的 ,然而水稻Lagrue不具有低磷耐性。水稻中早18的种子和Lagrue的种子三天发芽。然而,将幼苗种栽在一个30L的容器中,容器中含有“1.44mm硝酸铵等”组成的营养液。在第四片叶子萌发时,将植物各自转移至磷浓度将之0.05m

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