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第十一章 蛋白质合成 一、遗传密码 1. 特性 遗传密码是三联体,即三个核苷酸编码一种氨基酸 遗传密码统一了核酸中四种核苷酸序列与蛋白质中20种氨基酸序列的对应性 (42 = 16) 20 (43 = 64) 大多数氨基酸是由多于一个三联体编码的,这就称为遗传密码的简并性(有丰余)。 从固定的起点开始,mRNA的编码区内每3个相邻的碱基代表一个密码子,被某一特定tRNA分子的一端的互补三联体(或称反密码子)所识别。 三联体密码是以线性方式被读 中间不存在重叠 也不存在停顿 一旦阅读从正确的起始点开始,密码子就以相邻三联体的形式被破译。 密码子几乎是普遍适用的,有力地支持了所有生命都起源于共同祖先的假说。 2. 破译 大肠杆菌无细胞蛋白合成体系: DNase处理细胞裂解液,抑制转录 加入自然的或合成的mRNA( [poly(A)] + 19 种非放射性的氨基酸和1种放射性标记的氨基酸),进行有限的蛋白合成 体外翻译 分析被翻译的多肽 poly(U) ---UUU--- 多聚苯丙氨酸 poly(C) ---CCC---多聚脯氨酸 poly(A) ---AAA--- 多聚赖氨酸 poly(G) ---没有蛋白的合成,因为它形成了复杂的二级结构 合成的三核苷酸: 合成的三核苷酸能够附着在核糖体上,并与对应的氨酰-tRNA结合 经膜过滤后,只有核糖体、合成的三联体以及氨酰-tRNA形成的复合体才能保留在膜上 将含有所有氨酰-tRNA的混合物分成20组进行实验,每组含有一种被放射性同位素标记的氨基酸 特定三联体可明确地来指定特定的氨基酸 总共有61种密码子编码氨基酸,3个是终止密码子 Fig(1) 3. 特征 遗传密码具有简并性,即同一种氨基酸具有多个密码子 编码同一氨基酸的密码子称为同义密码子 在20中氨基酸中,除蛋氨酸和色氨仅有一个密码子外,其他18种均有一个以上的密码子 同义密码子不是随机排列的,多数同一氨基酸的密码子在同一方框内,通常只是第三个碱基不同 4. 突变效应 遗传密码的进化方式是以突变影响的最小化进行的 最常见的突变是转换 第三位的转换通常不改变其编码的氨基酸(例外:Met ? Ile; Trp ? stop),而颠换一半以上是无效的,或者导致相似氨基酸间的互换(Asp ? Glu) 第二位的转换将导致化学性质相似氨基酸间的转变,而颠换将改变氨基酸类型 第一位上的突变(转换或颠换)通常编码性质相似的氨基酸,甚至是同一种氨基酸。 二、tRNA的结构与功能 tRNA是将氨基酸转运到核糖体,并破译mRNA信息的转运器分子。 1. tRNA的一级结构 约60-95个核苷酸,通常为76 有许多修饰碱基,有时占到分子总碱基数的20% 2. tRNA的二级结构 三叶草结构 The 5’-and 3’-end are largely base-paired to form the amino acid acceptor stem which has no loop. Composed of 3 or 4 bp stem and a loop called the D-loop (DHU-loop) usually containing the modified base dihydrouracil(二氢尿嘧啶). Consisting of a 5 bp stem and a 7 residues loop in which there are three adjacent nucleosides called the anticodon which are complementary to the codon sequence (a triplet in the mRNA) that the tRNA recognize. Variable arm: 3 to 21 residues and may form a stem of up to 7 bp. T-arm is composed of a 5 bp stem ending in a loop containing the invariant residues GT?C. 3. tRNA的三级结构 共有9个氢键(三级氢键)帮助形成tRNA分子的三级结构 D臂和T臂上的碱基配对将tRNA分子折叠成L形,反密码子环在L形的一端,而氨基酸接受臂在另一端。 三、蛋白质合成概述 1. 密码子与反密码子的相互作用 当mRNA与tRNA在核糖体的凹槽处相遇时,tRNA一端的反密码子将与mRNA上的互补的密码子相互作用。 2. 核糖体结合位点 在原核生物mRNA起始密码子上游8-13和核苷酸处有一保守序列,可与核糖体小亚基中的16S rR
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