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02 琼脂糖凝胶回收DNA片段及检测 经典
实验 二琼脂糖凝胶回收DNA片段及检测 一、DNA片段的回收纯化 利用DNA凝胶纯化回收试剂盒(离心柱型)进行DNA纯化回收。 此试剂盒可用于琼脂糖凝胶DNA回收,PCR反应产物纯化回收,酶切产物DNA片段纯化回收,探针标记后纯化回收,DNA样品浓缩等。 1.试剂盒组成 溶胶/结合液DB 漂洗液WB 洗脱缓冲液EB 3M醋酸钠(PH5.2) 异丙醇 吸附柱 收集管(2ml) 2.原理简介 在高盐情况下,DNA片断选择性地吸附于离心柱内的硅基质膜上,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤去除杂质(引物、核苷酸、蛋白酶等),最后低盐,高PH值的洗脱缓冲液将纯净DNA从硅基质膜上洗脱。 3.操作步骤 1.在长波紫外灯下,用干净刀片将所需回收的DNA条带切下,尽量切除不含DNA的凝胶,得到凝胶体积越小越好。 2.将切下含有DNA条带凝胶放入1.5ml离心管,称重。 注意:先称一个空1.5ml离心管重量,然后放人凝胶块后再称一次,两次重量相减,得到凝胶的重量。 3.加三倍体积溶胶/结合液DB. 注意: 如果凝胶重为0.1g,其体积可是为100?l,则加入300?l溶胶液。凝胶块最大不能超过400mg,如果超过400mg,请用多个离心柱,进行回收。若胶浓度为2%,应加入6倍体积溶胶液。 4. 56℃水浴中放置10分钟(或直至胶完全溶解)。每2-3分钟涡旋震荡一次帮助加速溶解。 5.每100mg最初的凝胶重量加入150?l的异丙醇,震荡混匀。 注意:加入异丙醇可以提高回收率,加入后不要离心。 6.将上一步所得溶液加入吸附柱AC中(吸附柱放入收集管中),12,000 rpm离心30-60秒,倒掉收集管中的废液。 注意:如果总体积超过750?l,可分两次将溶液加入同一个吸附柱AC中。 7. 加入700?l漂洗液WB(已加入无水乙醇!),12,000rpm离心1分钟,弃掉废液。 8. 加入500?l漂洗液WB 12,000rpm离心1分钟,弃掉废液。 9. 将吸附柱AC放回空收集管中,12,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇影响下游反应。 10. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加30?l洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在65-70℃水浴中加热效果更好),室温放置2分钟,12,000rpm离心1分钟。 二、琼脂糖凝胶电泳 试剂: 1 ×TAE电泳缓冲液 琼脂糖 10×电泳加样缓冲液 溴化乙锭(EB) 1.制备凝胶 制备琼脂糖凝胶(1%) 1×TAE 50ml 琼脂糖 0.5g 放入50ml的锥形瓶中,加热溶化后再加入 溴化乙锭(EB)至总浓度为1 ?g /ml 灌入水平胶框,插入梳子,自然冷却。 凝胶在室温下放置30min,使其自然凝结,小心拔出梳子。 将凝胶放入电泳槽中,向电泳槽中加入电泳缓冲液,刚好没过凝胶约1mm。 2.加样 取回收的DNA样品30 ?l, 加样缓冲液3 ?l(10X),混匀,点入琼脂糖的样品孔内。 加样DNA marker DL2000 6 ?l 。 开始电泳(120V),当溴酚蓝迁移到距凝胶下缘2cm时,停止电泳。 利用紫外投射仪观察DNA条带。
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