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上机实习（八） 任务： LibSVM的使用 熟悉基因预测与蛋白质预测网络服务 生物信息学软件的意义 分析和处理实验数据和公共数据，加快研究进度，缩短科研时间。 提示、指导、替代实验操作，利用对实验数据的分析所得的结论设计下一阶段的实验。 用计算机管理实验数据。 1. LibSVM的使用 LibSVM是台湾大学林智仁(Lin Chih-Jen)教授等开发设计的一个SVM模式识别与回归的软件包； 提供了编译好的可在Windows系列系统的执行文件(exe文件)； 提供了源代码，方便改进、修改以及在其它操作系统上应用； 优点：1）参数调节相对比较少，提供了很多的默认参数，利用这些默认参数可以解决很多问题；2）提供了交叉检验(Cross Validation)的功能；3）可解决多类模式识别（2类以上）问题。 LibSVM的下载 .tw/~cjlin/libsvm/ 下载 解压 浏览文件夹 svm-scale.exe：标准化参数 svm-train.exe：训练数据 svm-predict.exe：利用训练好的模型进行预测 三个重要的命令： svm-toy.exe：图形化的例子(可忽略） Libsvm所需数据格式： +1 1: 0.3 2: 0.8 3: 7.0…… +1 1: 0.2 2: 0.5 3: 6.0…… +2 1: 1.3 2: 2.8