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Chapter 13 The Structure of Nucleic Acid 主要内容:主要介绍碱基、核苷、核苷酸和核酸的结构等。 核酸是由几十个甚至几千万个核苷酸聚合而成的具有一定空间结构的大分子化合物。 戊糖(pentose) 戊糖颜色反应 D-核糖+浓HCl + 绿色(苔黑酚法) D-2-脱氧核糖+ 蓝色(二苯胺法) 磷酸(phosphoric acid) 一、核苷酸 2.嘌呤碱(purine, Pu) 3.修饰碱基(modified base): 也称稀有碱基(minor base) 种类很多,多为甲基化的碱基,其中tRNA中含量较多,达10% 碱基的紫外吸收 最大吸收峰在260nm附近 (二)核苷(nucleoside) 核苷是由戊糖和碱基缩合形成的一种糖苷,糖和碱基之间以糖苷键相连接 1.核苷的结构 核苷中戊糖与碱基的连接方式: 天然核苷:一般为反式构象 核糖核苷(核苷):A、G、C、U 核苷 脱氧核糖核苷(脱氧核苷):dA、dG、dC、dT 2.修饰核苷(modified nucleoside): 也称稀有核苷(minor nucleoside) 修饰核苷包括三种情况: (1)由修饰碱基和糖组成的核苷 (2)由非修饰碱基和2-O-甲基核糖组成的核苷 (3)由碱基与糖连接方式特殊的核苷 (1) (3) 还有一些核苷,它们的碱基不是嘌呤环,但可把它们看作是鸟苷的衍生物,如Y核苷、Q核苷。 修饰核苷的简写符号 少数修饰核苷用单字符号如D、ψ、I;但大多数修饰核苷是将碱基取代基、取代位置和取代数目写在核苷单字符号的左边,用小写英文字母代表取代基。 取代基用下列小写英文字母表示 : 例: 注意: 含修饰核糖的核苷即2’-O-甲基核苷的表示方法,在核苷符号的右下方注上一个小写m。 例: 2’-O-甲基腺苷 Am m在核苷的左侧表示碱基被甲基化, m在核苷的右侧表示核糖被甲基化。 (三)核苷酸(nucleotide, Nt) 1.核苷酸的结构 (1)(核糖)核苷酸(ribonucleotide): 2’,3’,5’一核糖核苷酸 (2)脱氧(核糖)核苷酸deoxyribonucleotide): 3’,5’一脱氧核糖核苷酸 核苷酸的重要衍生物 1.ATP类的高能磷酸化合物 2.环状核苷酸 细胞内 : ATP cAMP + PPi 3.核苷多磷酸类 二、核酸的共价结构 核酸是由核苷酸聚合而成的生物大分子,无分支结构。核酸的共价结构也就是核酸的一级结构,通常是指核酸的核苷酸序列。 二、核酸的共价结构 (一)核酸中核苷酸的连接方式 (二)DNA的一级结构 简写方法:线条式、文字式 真核细胞染色体DNA结构 1.重复序列 (repeated sequence ) (1)高度重复序列 一个基因组中有几百甚至几百万份拷贝的高度重复序列,更多的则是很短的非编码序列的重复,它又称为卫星DNA。 (2)中度重复序列 一般指10份到几百份拷贝的DNA序列,通常是非编码序列。它包括一些蛋白质基因和RNA基因。 (3)轻度重复序列 一般指一个基因组内有2-10份拷贝 (4)单一序列 2.回文结构(palindromic structure) (1) 回文结构 (2) 发夹形和十字形 (三)RNA的一级结构 RNA的类别 1.核糖体RNA(ribosomal RNA, rRNA) 2.转移RNA(transfer RNA, tRNA) 3.信使RNA(messenger RNA, mRNA) 4.其它类别的RNA (1)病毒RNA(Viral RNA, rRNA) (2)核内RNA(nuclear RNA, nRNA) ① 不均一核RNA(heterogeneous nuclear RNA,HnRNA) ② 小分子核RNA(small nuclear RNA, sn RNA) ③ 小分子核仁RNA(small nucleolar RNA, sno RNA) ④ 染色体RNA(chrom
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