王金胜生物化学课集绪论.ppt

三维结构的作用力 范德华斥力 三维结构的作用力 范德华距离 范德华半径 离子键（盐键） 正电荷和负电荷之间的一种静电作用。 三维结构的作用力 + - Lys Asp 少数带相反电荷的侧链在分子的疏水内部形成盐键，稳定蛋白质的内部结构。 盐键也被用于稳定寡聚蛋白质结构（亚基之间的作用）。 三维结构的作用力 疏水作用(hydrophobic interaction): 非极性分子进入水中，有聚集在一起形成最小疏水面积的趋势，保持这些非极性分子聚集在一起的作用则称为疏水作用。 三维结构的作用力 分离的疏水基团周围的水分子排列成刚性的有序结构（笼形结构），当疏水基团聚集时，笼形结构被破坏，有序水分子的数量减少，水的混乱度增加，即熵增加，因此疏水作用是熵驱动的自发过程。 为了减少有序水分子的数量，非极性分子有聚集在一起形成最小疏水面积的趋势，保持这些非极性分子聚集在一起的作用则称为疏水作用。 三维结构的作用力 非共价键 本质 参与基团或原子 氢键 静电作用 由电负性原子与氢形成的基团＋电负性强带有孤对电子的原子 范德华力 静电作用 非极性基团 离子键 静电作用 带电荷的基团 疏水作用 熵驱动 疏水基团 氢键、盐键、疏水作用、范德华力均为非共价键 氢键对维持二级结构特别重要 疏水作用对维持三级结构特别重要 氢键、范德华力虽然键能小，但数量大 这些非共价键不仅稳定了蛋白质的三维结构，对蛋白质的功能也有重要的影响作用。 三维结构的作用力 二硫键 氢键 疏水作用 范德华力 离子键 二级 结构 三级结构 四级 结构 稳定蛋白质三维结构的作用力 一级结构 氨基酸 肽键 氢键 疏水作用 和范德华力 离子键 A.三级结构中的作用力 包括二硫键、氢键、盐键、疏水作用力、范德华力 氢键-侧链间形成 范德华力（分子间作用力，受彼此距离影响） 疏水键 -“非极性基团被极性水分子排挤相互聚拢”作用力。 离子键（或盐键） 4.3. 键 能 肽键 二硫键 离子键 氢键 疏水键 范德华力 90kcal/mol 3kcal/mol 1kcal/mol 1kcal/mol 0.1kcal/mol 这四种键能远小于共价键，称次级键 提问：次级键微弱但却是维持蛋白质三级结构中主要的作用力,原因何在? 数量巨大 4.4. 氢键 4.4.1氢键的饱和性和方向性 饱和性 当A－H中的氢原子与一个B原子结合形成氢键后，另一个电负性大的原子B’则难以接近氢原子了，因为B、A的负电荷将排斥原子B’靠近，因此一个氢原子只能与一个杂原子形成氢键。 方向性 1. 只有当A-H…B在同一直线上时最强； 2. 氢键的方向和未共用电子对的对称轴一致，这样可使原子B中负电荷分布最多的部分最接近氢原子，这样形成的氢键最稳定。 4.4.2.氢键的强弱 A、B的电负性越大，氢键越强；B的原子半径越小，氢键越强。（F-H…F最强） 4.4.3.天然化合物中的氢键举例—— 蛋白质结构中的氢键 核酸结构中的氢键 氢键是稳定蛋白质二级结构的主要作用力。氢键的形成情况：多肽的羰基氧和酰胺氢之间形成的氢键，除此之外，氢键还可以在侧链与侧链、侧链与介质水、主链肽基与侧链或主链肽基与水之间形成。 大多数蛋白质所采取的折叠策略是使主链肽基之间形成最大数目的分子内氢键(如α螺旋、β折叠片)，与此同时保持大多数能成氢键的侧链处于蛋白质分子的表面将与水相互作用 4.5.范德华力 (van der Waals force) 狭义的范德华力指是非极性分子或基团瞬时偶极间的静电相互作用，所以是一种很弱的作用力。 实际上范德华力包括引力和斥力两种相互作用。非共价键合原子或分子相互挨得太近时，由于电子云重叠，将产生范德华斥力。 虽然就其个别来说范德华力是很弱的，但是相互作用数量大并且具有加和效应，因此就成为一种不可忽视的作用力。 4.6.疏水作用(熵效应) （Hyphobic interaction） 水介质中球状蛋白质的折叠总是倾向于把疏水残基埋藏在分子的内部。这一现象被称为疏水作用或疏水效应，它在稳定蛋白质的三维结构方面占有突出地位。疏水作用其实并不是疏水基团之间有什么吸引力的缘故，而是疏水基团或疏水侧链出自避开水的需要而被迫接近。疏水作用的主要动力是蛋白质溶液系统的熵增的结果。 4.7.盐键(离子键) 盐键又称离子键，它是正电荷与负电荷之间的一种静电相互作用。在生理pH下，蛋白质中的酸性氨基酸(Asp和Glu)的侧链可解离成负离子，碱性氨基酸(Lys和His)的侧链可离解成正离子。在多数情况下这些基团都分布在球状蛋白质分子表面，而与介质