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人工湿地(SEEP)中重要微生物基因分布
人工湿地(SEEP)中重要微生物基因分布 摘 要:该论文旨在调查人工湿地SEEP的生态效益和影响。SEEP是与蓄水池相关的雨水生态建设项目的简称。该蓄水池具有不可否认的价值,但是却长期被人们忽视。经过集中调查研究之后,发现这和整个环境具有联系。例如,(1)产生数吨温室气体。(2)处理受污染的水源,例如从水中清除N和P资源。(3)关于碳、氮和硫循环的其他生态有利影响。因此,非常值得探索其功能并建立对湿地功能非常重要的基因分布基准线。该文通过使用DNA提取和PCR技术对SEEP中每个区划的不同基因种类(例如,dsrB、mcrA、nirK、nirS和amoA基因)进行了研究并将在此进行报告。 关键词:SEEP 人工湿地 dsrB基因 mcrA基因 nirK nirS基因和amoA基因 中图分类号:X17 文献标识码:A 文章编号:1674-098X(2014)11(a)-0119-03 湿地是一片无论是永久性还是季节性都充满水的区域,因此总是呈现出明显的生态系统特征。湿地与陆地最重要的区别就是湿地有还原性土壤,支持水生植物生长。 由于湿地对动植物和人类有至关重要的好处,成千上万的生态学家对湿地进行了无数次研究,即使人们过去认为湿地毫无用处,但是现在人们对该系统优势的认识正处于热火朝天的趋势。湿地巨大的、不可或缺的价值包括: (1)具有商业价值的鱼类栖息地。 (2)地下水补给。 (3)休闲机会,例如疗养。 (4)美学价值。 (5)改善水质。 (6)厌氧区域的研究价值。 在地球上,有几种微生物对碳循环、氮循环和硫循环相关的生态系统具有重要的作用。 至于碳循环,湿地可以作为蓄水池储存非完全氧化碳源或产生甲烷和其他温室气体。 硫酸盐还原菌(SRB)可以对重金属的直接和间接降解进行调解并有助于有机污染物进行生物降解(3)。因此,使用这些细菌处理径流水非常有利。SRB还可以将硫酸盐异化作用和异养碳降解或二氧化碳固定进行结合,碳酸盐还原会直接影响湿地中的碳循环(17)。对于我的项目来说,我将更加关注相关基因的相对丰度。在这些细菌中所发现的普通基因是dsrB(异化酸性亚硫酸盐还原酶)基因。我将通过对比这种基因的浓度发现人工湿地的特殊功能。至于其他功能,他们对产甲烷的降解途径所涉及的含微生物的酶作用物的竞争非常有利(4)。这意味着这些含dsrB基因的细菌也可能参与了产甲烷菌作用。关于湿地甲烷通量的硫酸盐还原作用在将来有望进一步扩展。 产甲烷菌是地球碳循环过程中的一种必要成分。他们可以在使用氢进行二氧化碳降解或转移甲基化混合物之前进行厌氧催化产生甲烷。有一种酶能够刺激受辅酶-M(被称为甲基辅酶-M还原酶(MCR))束缚的甲基还原。这种酶能够调节甲烷产生路径中的目标过程(10)。在特定环境中,例如高pH或高温环境,人们认为这种受产甲烷菌支配的酶种类繁多。这个因素可能影响湿地SEEP的生态系统(2、10、)。所以,我只选取了mcrA基因作为本项目的目标基因,调查是否任何区划都能产生与其他循环和生物作用相结合的甲烷。 至于氮循环,由于湿地近似于还原环境,用于处理受污染的城市径流水,因此我选取了脱氮菌作为研究目标。这指的是水中氮源的降解。现在也有一些详细说明脱氮作用基因的论文。我选取了nirK和nirS(亚硝酸还原酶)基因进行试验。脱氮是一种厌氧过程,因为我们需要足够的水覆盖土壤。这个过程也结合了其他循环。 最后一种我所感兴趣的基因就是amoA(氨单加氧酶)基因。这种基因在湿地中不容易发现,因为含有这种基因的微生物通常生活在含氧环境中。其他科学家已经提纯出了一种将单加氧酶特有遗传密码编入亚硝酸单胞菌物种中的特殊缩多氨酸,并且我可以从其他论文中获取这些内容(8)。这些细菌可以调解硝化作用中的一个非常重要的步骤(6)并参与甲烷和一氧化碳循环过程(8、9和10)。除此之外,他们还降解有机物,减少臭味(6)。我们最近发现越来越多的环境科学家在进行厌氧环境中微生物的研究(9)。这也是选择这种基因的最重要的原因。 1 研究方向 雨水生态建设项目(SEEP)开始于1995年,用于在自然区和教学实验室(NATL)范围中其所在地内的研究和教育。从根本上说,这是一个人工湿地,用于处理污染水并在深贮水池中存储淡水。 雨水径流指大暴雨时或之后从土地中流走的水。这种径流会造成大量污染物流入河流、湖泊或土壤下方的地下水中。在暴雨中流走的污染物的类型和来源包括:重金属、悬浮体、氯化物和其他化学成分,例如碳氢化合物(9)。这些污染物会极大地影响水体的质量和相关生态系统。在城市化地区(例如,大都市),每天都会产生大量废弃物,如垃圾、油料和重金属。这些污染物污染了水下的土壤。这些土壤通过生物富集会对人类或
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