虾夷扇贝Patinopecten Yessoensis近交衰退的生物学效应及遗传机理研究.pdf.doc

虾夷扇贝(Patinopecten Yessoensis)近交衰退的生物学效应及遗传机理研究谨以此文献给教育鼓励我的导师包振民教授、王师教授，辛苦抚养我多年的父母和默默支持我的爱人傅 强 虾夷扇贝(Patinopecten Yessoensis)近交衰退的生物学效应及遗传机理研究虾夷扇贝(Patinopecten Yessoensis)近交衰退的生物学效应及遗传机理研究学位论文完成日期：指导教师签字：答辩委员会成员签字： 虾夷扇贝(Patinopecten Yessoensis)近交衰退的生物学效应及遗传机理研究独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含未获得（注：如没有其他需要特别声明的，本栏可空）或其他教育机构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签字日期：年月日---------------------------------------------------------------------学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，并同意以下事项：1、学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。2、学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权清华大学“中国学术期刊（光盘版）电子杂志社”用于出版和编入 CNKI《中国知识资源总库》，授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：导师签字：签字日期：年月日签字日期：年月日 虾夷扇贝(Patinopecten Yessoensis)近交衰退的生物学效应及遗传机理研究虾夷扇贝(Patinopecten Yessoensis)近交衰退的生物学效应及遗传机理研究摘要近交衰退作为一种重要的遗传学现象，在动植物中广泛存在。由近交而引起的生物适应性衰退一直是进化生物学、物种保护和育种等领域的研究重点。海洋双壳贝类由于其高繁殖力及多样交配系统，正逐渐成为研究近交衰退的良好模式生物。虾夷扇贝（Patinopecten yessoensis）是我国北方重要的经济养殖贝类，近年来养殖群体出现了一定的近交现象，本研究从性状、基因组和转录组三个水平对虾夷扇贝近交衰退的表现、可能的遗传机制、表达谱特点等方面进行研究。1.虾夷扇贝近交衰退的生物学效应虾夷扇贝通常是雌雄异体，但在养殖群体中发现了一定比例的雌雄同体现象。本研究利用雌雄同体的虾夷扇贝构建了近交系数为 0.5的自交家系，同时构建了近交系数为 0.25的 F2代家系和普通对照家系，通过记录不同近交系数、在生活史不同阶段的不同性状分析虾夷扇贝中的近交效应。研究发现不同的近交系数对衰退率的影响不同：自交系孵化率的衰退是 F2代的 6.2倍，自交系幼虫不同阶段存活率、生长性状的衰退较 F2家系也分别提高了 3.7~7.8、1.5~3.1倍。不同性状在近交衰退中的表现也不同，与适应性联系紧密的性状如孵化率、存活率等的衰退要比生长性状严重的多，并且都随着时间的推移更加严重。当 F提高 10%时，生活史不同时期的存活率衰退率在 7.84%~15.85%之间，而生长性状的衰退仅有0.93%~5.13%。适应性性状和生长性状可能受不同位点、不同方式调控，生长性状可能是受微效多基因的加性效应；而适应性性状可能受一些主效基因控制，同时也受与生理活性相关的小效应位点控制，并且位点间还存在明显的上位和互作效应。本研究还从清除遗传负荷的角度探讨了淘汰有害基因的可能性，认为近交衰退很可能是海洋生物维持高杂合度的一种驱动力。2.基于自交家系的遗传连锁图谱构建和标记偏分离分析本研究利用高通量全基因组 SNP分型技术 2b-RAD，以虾夷扇贝自交系 96个 F1代个体为作图群体，构建了虾夷扇贝 SNP高密度遗传连锁图谱。图谱包含 虾夷扇贝(Patinopecten Yessoensis)近交衰退的生物学效应及遗传机理研究1289个 SNP标记，19个连锁群，总长度 1633.87cM，标记平均间隔为 1.29cM，图谱覆盖率为 98.3%。对所有分型标记进一步分析，发现有 58.8%的标记偏离孟德尔分离比。配子偏分离（50.96%）与合子偏分离（49.04%）的比例大致相当。合子偏分离基本可以分为杂合子过剩（ 43.79%）与纯合子缺失（45.10%），进一步分析发现一部分杂合子过剩很有可能是由于连锁的有