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5、獭兔便型及体重与其细菌群落的关系 [5]
Scientific Reports 2015 IF：5.578
关键词：獭兔；肠道微生物；16S V4
本文研究了来自不同獭兔同日产下的 80 只幼崽，第 70 天分别挑选体重最重和最轻的 10 只兔子，第 90 天再测定这
20 只兔子的体重并收集他们的硬粪和软粪，用于研究兔子体重和便型与肠道微生物的关系。利用 16S V4 区结合 α 多样
性、β 多样性、LEfSe 分析对肠道微生物进行了研究。结果显示，獭兔硬粪个体菌群在高低体重组间差异显著，而软粪个
体菌群在高低体重组间差异却不显著，这一发现刷新了人们对獭兔后肠菌群和体重关系的认识；在硬粪个体中高体重獭兔
的微生物群落与低体重獭兔的有差异，然而在软粪个体中未表现出微生物群落差异。Ruminococcaceae 和 Akkermansia
spp. 在软粪个体中为优势物种；LEfSe 分析寻找显著性差异物种：獭兔硬粪个体显著性差异物种较软粪个体中多。
图 8 不同体重獭兔细菌群落结构及丰度分析 图 9 不同体重的獭兔粪便微生物物种注释
獭兔不同体重和便型的微生物群落结构及丰度 （左上）、 獭兔不同体
重和便型的细菌组成结构 PCoA 分析（右上）、 獭兔硬粪中微生物群
落 PCoA 分析 （左下）和獭兔软粪中微生物群落 PCoA 分析（右下）
参考文献
[1] Findley K, Oh J, Yang J, et al. Topographic diversity of fungal and bacterial communities in human skin [J].
Nature, 2013, 498(7454): 367-370.
[2] Mejía-León M E, Petrosino J F, Ajami N J, et al. Fecal microbiota imbalance in Mexican children with type
1 diabetes [J]. Scientific reports, 2014, 4: 3814.
[3] Peiffer J A, Spor A, Koren O, et al. Diversity and heritability of the maize rhizosphere microbiome under
field conditions [J]. P
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