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基因转录及加工逆转录
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第十三章 基 因 的 转 录、转 录 后
加 工 及 逆 转 录
转录 (transcription) XE 转录 (transcription) 是以DNA单链为模板,NTP为原料,在DNA依赖的RNA聚合酶催化下合成RNA链的过程。与DNA的复制相比,有很多相同或相似之处,亦有其特点,它们之间的异同可简要示于表13-1
表13-1 转录与复制的异同
差 异 相 同
转录 复制 或相似
模板 基因的模板链转录 2股链均全复制 DNA
原料 NTP dNTP 核苷三磷酸
碱基配对 A-U,T-A;G-C A-T;G-C 遵从碱基配对原则
聚合酶 RNA聚合酶 DNA聚合酶 依赖DNA的聚合酶
产物 mRNA,tRNA,rRNA等 DNA 多核苷酸链
转录的模板是单链DNA,与复制的模板有较多的不同特点,引出了下列相关概念。转录过程只以基因组DNA中编码RNA(mRNA、tRNA、rRNA及小RNA)的区段为模板。把DNA分子中能转录出RNA的区段,称为结构基因(structure gene) XE 结构基因(structure gene) \y jie2gou4ji1yin1 。结构基因的双链中,仅有一股链作为模板转录成RNA,称为模板链(template strand) XE 模板链(template strand) ,也称作Watson(W)链(Watson strand) XE Watson链Watson strand) 、负(-)链(minus strand) XE 负(-)链(minus strand) 或反意义链(antisense strand) XE 反意义链(antisense strand) 。与模板链相对应的互补链,其编码区的碱基序列与mRNA的密码序列相同(仅T、U互换),称为编码链(coding strand) XE 编码链(coding strand) ,也称作Crick(C)链(Crick strand) XE Crick(C)链Crick strand 、正(+)链(plus strand) XE 正(+)链(plus strand) ,或有意义链(sense strand) XE 有意义链(sense strand) 。不同基因的模板链与编码链,在DNA分子上并不是固定在某一股链,这种现象称为不对称转录(asymmetric transcription) XE 不对称转录(asymmetric transcription) 。模板链在相同双链的不同单股时,由于转录方向都从5’→3’,表观上转录方向相反,如图13-1。
与DNA复制类似,转录过程在原核生物和真核生物中所需的酶和相关因子有所不同,转录过程及转录后的加工修饰亦有差异。下面的讨论中将分别叙述。
参 与 转 录 的 酶
转录酶(transcriptase) XE 转录酶(transcriptase) \y zhuan3lu4mei2 是依赖DNA的RNA聚合酶(DNA dependent RNA polymerase,DDRP), XE 依赖DNA的RNA聚合酶(DNA dependent RNA polymerase,DDRP) \y yi1lai4de5ju4he2mei2 亦称为DNA指导的RNA聚合酶(DNA directed RNA polymerase) XE DNA指导的RNA聚合酶(DNA directed RNA polymerase) ,简称为RNA聚合酶(RNA pol) XE RNA聚合酶(RNA pol) 。它以DNA为模板催化RNA的合成。
原核生物和真核生物的转录酶,均能在模板链的转录起始部位,催化2个游离的NTP形成磷酸二酯键而引发转录的起始,如图13-2所示。因此,转录的起始不需引物,这也是转录与复制在起始阶段的一大区别。
一、 原核生物的RNA聚合酶
细菌中只发现一种RNA聚合酶,能催化mRNA,tRNA和rRNA等的合成,研究得比较清楚的是大肠杆菌(E coli)的RNA聚合酶。
(一) 大肠杆菌RNA聚合酶的组成
大肠杆菌RNA聚合酶的分子量约
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