马传染性贫血病毒强毒株eiavln40gag和gp45基因体内进化研究-study on in vivo evolution of strong equine infectious anemia virus strain eiavln 40g ag and gp45 genes.docxVIP

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2018-07-27 发布于上海
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马传染性贫血病毒强毒株eiavln40gag和gp45基因体内进化研究-study on in vivo evolution of strong equine infectious anemia virus strain eiavln 40g ag and gp45 genes.docx

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马传染性贫血病毒强毒株eiavln40gag和gp45基因体内进化研究-study on in vivo evolution of strong equine infectious anemia virus strain eiavln 40g ag and gp45 genes

hosts.substitutionsoftranslatedaminoacidresiduesofp15genewereinthe16thN/Sand122ndM/Eaboutthreehorses;substitutionsoftranslatedaminoacidresiduesofp9genewereinthe67thF/L、115thE/Gand122ndK/Maboutthreehorses;substitutionsoftranslatedaminoacidresiduesofgp45-ⅠgenewereintheninthT/F/Landaboutthreehorses;substitutionsoftranslatedaminoacidresiduesofgp45-Ⅱgenewereinthe21stE/K、29thG/S和33rdV/Taboutthreehorses.Inaddition,thep15、p9、gp45-Ⅰandgp45-Ⅱgenesequencesofsamplesatthe2ndperiodfromhorse#2andsamplesatthe1stperiodfromhorse#3appearedlowerdivergencetotheconsensusp15、p9、gp45-Ⅰandgp45-ⅡgenesequenceofEIAVpathogenicstrainsEIAVLN40.Theresultshowedthattheaveragedivergenceofnucleotideandaminoacidofp15genewere1.8%(0-2.9%)and1.7%(0-3.6%)respectively,p9genewere2.5%(0.3%-3.8%)and2.9%(0-4.8%)respectively,gp45-Ⅰgenewere1.3%(0.3-2.1%)and1.8%(0-3.2%)respectively,gp45-Ⅱgenewere2.1%(0-3.4%)and2.6%(0-4.7%)respectively,comparedwithEIAVLN40.Moreover,duringthefeverperiodofEIA,thedivergenceofeachnucleotideandaminoacidwasinalowerlevelorevennochange;whiletheratewasrelativelyhighinthesub-clinicalstage.phylogenetictreeanalysisofp15gene(the#2horseat68dayand#3horseat22daypost-infection)showedthatthegenesequencesinfeverperiodwereonthesamebranchwithEIAVLN40,butothersatothertimepointswereonanotherbranch;evolutionaryanalysisofothergenesissimilartothep15gene.ThisstudyfirstanalyzeevolutioninvivoofEIAVLN40p15、p9、gp45-Ⅰandgp45-Ⅱgene,whichwillfacilitatethestudiesonproceduresofinfectionofpathogenicEIAVLN40andattenuatedmechanism.Keywords:Equineinfectiousanemiavirus;p15gene;p9gene;gp45-Ⅰgene;gp45-Ⅱgene;VariationanalysisDirectedby:Prof.WANGFenglongProf.ZHOUJianhuaApplicantforMasterdegree:LIUQiang(BasicVetSci)(CollegeofVeterinary,InnerMongoliaAgriculturalUniversity,Huhhot010018,China)目录1引言.................................................................11.1马传染性贫血病毒概述............................................21.1.1马传染性贫血病毒的病原性与生态学..............................21.1.2EIAV形态结构和理化特性21.1.3EIAV的生物学特性31.2马传染性贫血病毒的分子生物学........