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1011易位甲基胞嘧啶双加氧酶―1结构和去甲基化作用及生物学功能
1011易位甲基胞嘧啶双加氧酶―1的结构和去甲基化作用及生物学功能
[摘要]101l易位甲基胞嘧啶双加氧酶(TET)-1是发挥DNA去甲基化作用重要的蛋白质之一,始见于急性髓系白血病相关的染色体易位t(10;11)(q22;q23)的白血病患者,其c端为双加氧酶区,是TET-1的主要催化功能结构域,可将5-甲基胞嘧啶(5-mC)氧化为5-羟甲基胞嘧啶,经主动或被动去甲基化实现DNA去甲基化。TET-1通过参与DNA去甲基化调节基因表达,在胚胎发育、体细胞重编程、肿瘤发生、神经细胞发生发育等过程发挥作用,在成体细胞中参与调控细胞分化与增殖。TET-1蛋白及其介导的5-mC羟甲基化过程深化了人们对DNA碱基修饰多样性及复杂性的认识,其在干细胞增殖与分化和肿瘤发生等过程中的功能研究,为诸多生理现象和疾病发生发展作了新的诠释。
[关键词]1011易位甲基胞嘧啶双加氧酶;DNA甲基化;DNA去甲基化;5-甲基胞嘧啶;5-羟甲基胞嘧啶
[中图分类号]Q 51 [文献标志码]A [do]10.7518/gjkg.2015.03.019
DNA甲基化或去甲基化是重要的表观遗传修饰形式之一,DNA甲基化指DNA中CpG二核苷酸的胞嘧啶(C)被选择性添加甲基,DNA去甲基化则是去除甲基的过程,两者参与调节基因的表达,与个体生长发育及各项生理活动密切相关。1011易位甲基胞嘧啶双加氧酶(ten-eleven translocation methylcvtosine dioxygenase,TET)-1可以将5-甲基胞嘧啶(5-methyl cytosine,5-mc)氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethvl cytosine,5-hmc),进一步经主动或被动去甲基化实现DNA去甲基化,是发挥DNA去甲基化作用的重要蛋白质。TET-1通过参与DNA去甲基化调节基因表达,在胚胎发育、体细胞重编程、肿瘤发生等过程起重要作用。
1.TET-1的结构
TET-1初始发现于急性髓系白血病相关的染色体易位t(10;11)(q22;q23)的白血病患者,故此得名。TET-1基因位于10q22,至少含12个外显子,编码2 136个氨基酸,蛋白的相对分子质量为2.353×10。TET-1属于a-酮戊二酸(U-OXOghtarate,ot-OG)和Fe2+依赖的双加氧酶,其N端有一个典型的CXXC型锌指结构,因此也称CXXC6和LCX(leukemia-associated protein with a CXXC domain)等。其C端为双加氧酶区,称SD区,由富含半胱氨酸区、双链B螺旋2-OG-Fe2+-依赖的双加氧酶区(double-stranded B-helix 2-OG-Fd+-dependent dioxygenase domain,DSBH)及间隔区组成,具有氧化活性,是TET的主要催化功能结构域,可将5-mC转化为5-hmC。除上述结构域外,TET-1含有的三个核定位信号(AA20-50、620-653、1158~1162),可与DNA结合,提示其在核内的潜在功能。TET-1不仅可识别、结合未修饰的胞嘧啶,更倾向于结合被修饰的5-mC和5-hmC且富集于高CpG区域。
2.TET-1的去甲基化作用
TET-1主要在胎儿组织和干细胞中表达,参与DNA主动及被动去甲基化,即5-mC转化为5-hmC的过程。其主动去甲基化催化机制为:在Fe2+和维生素c的辅助下,氧和a-OG在为5-mC提供羟基的同时,a-OG氧化脱羧生成琥珀酸,5-mC则转化为5-hmC。5-hmC是去甲基化过程中重要的中间体,一方面,5-hmc可在活化诱导脱氨酶(activation-induced deaminase,AID)或载脂蛋白B RNA编辑催化蛋白(apolipoprotein B mRNAediting catalytic component,APOBEC)-1催化下生成5-羟甲基尿嘧啶(5-hydroxymethyhracil,5-hmU),5-hmu被胸腺嘧啶-DNA糖基化酶(thymine-DNA glycosylase,TDG)识别并切除,最终通过碱基切除修复(base excision repair,BER)途径将该位点转化为c,实现DNA去甲基化;另一方面,TET-1可进一步催化5-hmC转化为5-甲酰胞嘧啶(5-formyl cytosine,5-fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxyl cytosine,5-caC),后者可被TDG识别并切除,经BER途径实现甲基去除。此外,TET-1与胞嘧啶及修饰后胞嘧啶的结合可能阻碍后者与DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNM
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