曙光集群管理使用册V1.1.docVIP

PAGE \* MERGEFORMAT 13 曙光信息产业公司 地址：北京市海淀区水磨西街64号 邮政编码：100084 HYPERLINK 电话：010 传真：010曙光高性能集群使用手册 2010-3- 目录 TOC \o 1-2 \h \z \u HYPERLINK \l _Toc257452717 一、 曙光高性能集群概况 PAGEREF _Toc257452717 \h 2 HYPERLINK \l _Toc257452718 二、 用户管理 PAGEREF _Toc257452718 \h 4 HYPERLINK \l _Toc257452719 2.1. 添加用户 PAGEREF _Toc257452719 \h 4 HYPERLINK \l _Toc257452720 2.2. 删除用户 PAGEREF _Toc257452720 \h 4 HYPERLINK \l _Toc257452721 2.3. 系统自动同步用户信息 PAGEREF _Toc257452721 \h 4 HYPERLINK \l _Toc257452722 2.4. 设置用户磁盘配额 PAGEREF _Toc257452722 \h 4 HYPERLINK \l _Toc257452723 三、 作业调度管理 PAGEREF _Toc257452723 \h 6 HYPERLINK \l _Toc257452724 3.1. 队列管理 PAGEREF _Toc257452724 \h 6 HYPERLINK \l _Toc257452725 3.2. 用户权限控制 PAGEREF _Toc257452725 \h 7 HYPERLINK \l _Toc257452726 3.3. 作业记账功能 PAGEREF _Toc257452726 \h 8 HYPERLINK \l _Toc257452727 四、 软件使用 PAGEREF _Toc257452727 \h 9 HYPERLINK \l _Toc257452728 4.1. 编译器 PAGEREF _Toc257452728 \h 9 HYPERLINK \l _Toc257452729 4.2. 数学库 PAGEREF _Toc257452729 \h 9 HYPERLINK \l _Toc257452730 4.3. MPI并行库 PAGEREF _Toc257452730 \h 10 HYPERLINK \l _Toc257452731 4.4. VASP PAGEREF _Toc257452731 \h 11 HYPERLINK \l _Toc257452732 4.5. WIEN2K PAGEREF _Toc257452732 \h 13 HYPERLINK \l _Toc257452733 4.6. ABINIT PAGEREF _Toc257452733 \h 15 曙光高性能集群概况 曙光高性能集群共有40台CB-85刀片计算节点，1台登录管理节点，一套磁盘整列提供存储。提供3套互联网络：千兆管理网用于集群管理和用户登录；千兆计算网作为辅助计算网络也兼作管理网；InfiniBand高速计算网用于并行程序通信，也负责为整个集群提供NFS文件共享服务。集群主机名和各网络的IP地址对应如下： 主机名 千兆管理网 千兆计算网 InfiniBand高速网 登录管理节点 node41 1 1 1 计算节点 node1 node2 … … … … node40 0 0 0 每台CB-85刀片计算节点配有4颗AMD Opteron 8374HE 2.2 GHz 四核处理器，总共16个CPU核心，内存大小为32 GB。操作系统为SuSE Linux Enterprise Server 10 SP2。 磁盘阵列提供两个6.3 TB大小的存储空间，分别映射到登录管理节点node41的/home1和/home2目录，用于存放公用程序和用户数据，这两个目录作为NFS共享目录，通过InfiniBand高速网共享给整个集群。 登录管理节点node41的所网IP地址为：5。Windows客户端可以用SSHSecureShellClient，PuTTY，SecureCRT，Xshell等SSH软件登录，Linux客户端直接在终端命令行执行： $ ssh HYPERLINK mailto:username@5username@5 注：5之前为IBM机器IP，如果登录时