反向分子对接技术在中药作用靶点预测有效成分筛选及作用机制探索中应用.docVIP

反向分子对接技术在中药作用靶点预测有效成分筛选及作用机制探索中应用 　　[摘要] 中药现代化研究逐步成为世界性的潮流。反向对接技术也逐步成为中药现代化研究的有利工具，将一个小分子药物对接在一组临床相关大分子靶标的潜在结合腔中，通过对结合特征的详细分析，根据结合紧密程度对靶标进行排名，从而潜在地鉴定可能与其作用机制或副作用相关药物的新分子靶标。近年来，为了探索中药的作用机制、筛选中药有效成分以及寻找药物作用于疾病的靶点，反向分子对接技术被广泛运用并取得了瞩目的成绩。该研究通过文献综述，总结反向分子对接技术应用于中药作用靶点、有效成分筛选及中药潜在作用机制探索的情况，为中药临床研究及新药研发提供更多的理论依据。 　　[关键词] 中药； 反向分子对接； 对接软件； 数据库 　　[Abstract] Traditional Chinese medicine（TCM） modernization has gradually become a worldwide trend. Reverse docking technology has also gradually become a useful tool for TCM modernization. It involves docking a small-molecule drug in the potential binding cavities of a set of clinically relevant macromolecular targets. Detailed analysis of the binding characteristics was used for the ranking of the targets according to the tightness of binding. This process can be used to potentially identify the novel molecular targets for the drug which may be relevant to its mechanism of action or side effect.In order to explore the action mechanism， screen the active ingredients and seek the treating target of TCM， reverse molecular docking technology has been widely used and has achieved remarkable results in recent years. In this review， we summarized the application of reverse molecular docking technology in the target seeking， active ingredients screening and potential mechanism exploration of TCM， which may provide more scientific basis for the clinical research and development of new herbal drugs. 　　[Key words] traditional Chinese medicine； reverse molecular docking； docking software； database 　　目前，药物研发处于瓶颈时期，使用传统的“多个配体-单靶点”[1]的研发方法使得药物创新变得困难，发现一个新分子实体并应用于市场的成本超过20亿美元[1]，然而回报率却远远低于投资成本且耗时。“多个靶点-单配体”研究策略即反向分子对接技术有效的解决了这些难题，并成为药物重新定位的有利工具，尤其是在中药相关靶点筛选方面应用广泛。 　　中药治疗疾病的有效性有目共睹，且副作用小，但中药发挥治疗作用的成分及作用于疾病的相关靶点与作用机制仍然不明确。如何寻找中药治疗疾病的相关靶点，如何找到中药治疗疾病的有效成分，如何预测中药潜在的作用机制，是科研人员面临的亟待解决的难题。反向分子对接技术[2]是基于分子对接技术之上，是分子对接技术的逆向思考，它以小分子或者化合物作为探针，在具有三维结构的靶点数据库内进行对接，通过空间匹配和计算小分子与靶点之间的能量，对小分子化合物作用靶点进行筛选，从而预测药物作用的潜在靶点。反向分子对接技术基于“锁钥匙模型”[3]，在一组与临床相?P的大分子靶标结合腔中插