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分享4个基因分析的网址.PDF
分享4个基因分析的网址
之前给大家介绍过两个数据库,GeneCard和MalaCard数据库,大家不要一脸懵逼地看着我们,会心
碎,实在记不得了请点这两个超链接(如何快速了解一个疾病的综合性信息? 基因信息查询网址,一
个就够 )。
今天给大家接着讲这两个数据库里好用的小工具。需要提醒的是,这些分析需要教育机构的邮箱进行注
册,如果没有的请火速读博,从此过上幸福生活(博士的幸福生活I, II, III )。
1、GeneAnalysis (/#input ):
这个在线工具只能分析人的基因和老鼠的基因。这个在线工具其实就是对于多个基因进行整合的分析,
如图即是网页的初始界面。
我们点击分析以后,会发现看到这些基因共同的汇总信息,如图
我们可以通过结果的分类来观察这些结果的具体信息。其主要分类有:组织中的表达情况;和输入基因
相关的疾病;通路分析;GO分析;表型分析和分子组成分析
2、GeneAlaCart(/Query):
假如我有一些基因,我想下载这些基因所有各自相关的信息,那么我就可以用这个软件。网页的初始界
面如图,我们只需要填入基因,选择自己想要保存的分类内容,然后点击提交即可,然后结果会以
excel的形式保存下来。
在下载下来的excel格式中,如果全选的话一共有26个分类,包括molecular function descriptions,
phenotypes, human phenotyeontology, biological Processes, Cellular Components,
Molecular Functions, Pathways, Interactions, Super Pathway等等。
3、Genes Likes me(/#input):
如果我有一个基因,我想知道和基因相似的其他基因有哪些,那么这个软件就可以帮我们做到。
如图数据基因名即可
我们来输入TP53 ,即可看到结果如下,排在前面的TP63\TP73为TP53 同家族的:
4、VarElect (/#input )
如果我有一些基因,我想知道这些基因的哪些基因是和某一临床表型相关,我就可以用这个分析工具。
如图,我们在左边的方框输入基因名,enter phenotype keywords(输入临床表型关键词)输入deaf(
举个例子) 。
结果如下,GJB2与GJB6与deaf相关,其中GJB2最相关。
今天就策到这里,希望对大家有帮助。
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