第11章微物分类及鉴定.pptVIP

第十一章 微生物的分类和鉴定 什么是微生物分类学(microbialtaxonomy) 二. 分类单元及其等级 界(亚界 ) 门(亚门 ) 纲(亚纲 ) 目(亚目 ) 科(亚科 ) 属(亚属 ) 种(亚种 ) 1. 种(species): 物种，生物分类中基本的分类单元和分类等级。 具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其他类群的菌株有很明显的区别。 DNA杂交同源性在60-70%以上;或者 16S rRNA序列同源性达97%以上的菌株定为一个种. 2. 亚种(subspecies): 是正式分类单元中地位最低的分类等级 当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性状而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元--亚种。 新种：新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许研究人员从中取得该菌种。 美国典型培养物保藏中心（ATCC）、德国微生物及细胞保藏中心（DSM） 国际系统细菌学杂志（IJSB） 型(form或type) 常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 三.微生物的命名 命名：菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。 命名原则（双名法）： 学名=属名+种名加词+（首次定名人）+现名定名人和现名定名年份 规定与常识：属名，首字母大写、单数、斜体。 种名加词，首字小写、斜体。 学名=属名＋种的加词＋（首次定名人）＋现名定名人＋定名年份  必要，用斜体排字 可省略，均用正体排字 例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌） Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 例2：金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 在前后有两个或数个学名排在一起，且在其属名相同的情况下，后一学名中的属名可缩写成一个、两个或三个字母，其后加一点。如： Bacillus可写成“B．”或“Bac．”； Pseudomonas可写成“P．”或“Ps．”； Aspergillus可写成“A．”或“Asp．”等。 在实际工作中，有时筛选到一个有用的菌种，其属名很易确定，但种名还未确定。在这种情况下，当发表论文或进行学术交流时，其种的加词暂时可以用“sp．”（正体字）代替。例如： “Bacillus sp．”即表示一个尚未定出种名的芽孢杆菌，可译为“一种芽孢杆菌”； “Bacillus spp．”（spp．为species复数的简写）表示一批尚未定种名的芽孢杆菌，故可译为“若干芽孢杆菌”。 系统学系统 Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology 《伯杰氏系统细菌学手册》 1984~1989 第一版（4卷）(以DNA、rRNA为分类依据) 2000~ 第二版（5卷）(以DNA、rRNA、蛋白质序列分析为分类依据) 细菌分类系统----Bergey’s Manual 鉴定系统： Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology 《伯杰氏鉴定细菌学手册》 1923年，细菌学家David Bergey 1974年，第8版 1994年, 第9版 Ainsworth分类系统第八版（1995年） 11.2 微生物分类鉴定的特征和技术 主要步骤 获得纯培养物 测定一系列必要的鉴定指标 查找权威性菌种鉴定手册 不同微生物的不同重点鉴定指标 例：细菌——形态、生理、生化遗传等指标 放线菌和酵母菌——形态和生理特征并用 霉菌等形体较大的真菌——以形态特征为主 微生物的快速分类鉴定方法 （一）氨基酸序列和蛋白分析 （二）核酸的碱基组成和分子杂交 （三） rRNA寡核苷酸序列分析 核酸的碱基组成和分子杂交 2. 核酸分子杂交法 rRNA的序列分析 16S rRNA (18S rRNA)所以被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺” 二 微生物分类鉴定中的现代方法 （一）氨基酸的顺序和蛋白质的分析 蛋白质是基因的产物,.蛋白质的氨基酸顺序直接反映mRNA顺序而与编