章节核酸的构与功能.pptVIP

第三章 核酸的结构与功能 第一节、核酸的结构 一、 核酸的组份 基本结构单位：核苷酸（碱基、戊糖和磷酸） 碱基：尿嘧啶（Uracil, U） 胸腺嘧啶(Thymine, T) 胞嘧啶(Cytosine, C) 腺嘌呤(Ademine, A） 鸟嘌呤（Guanine, G） 次黄嘌呤、稀有碱基 DNA：A、T、G、C RNA：A、U、G、C 戊糖：核糖（RNA）、脱氧核糖（DNA） 核苷：戊糖的β半缩醛羟基与碱基中的氢失水缩合成N-糖苷键而形成核苷，核苷酸：核苷的5′-位羟基与磷酸通过酯键形成5′-核苷酸，不同的核苷酸用碱基第一个字母来命名。嘌呤和嘧啶：都是含氮杂环化合物，弱碱性，难溶于中性水溶液。杂环上的氮等参与氢键的形成。 二、多核苷酸链 结构：由核苷酸通过3`，5`-磷酸二酯键连成的线型分子。 骨架：由磷酸和2`-脱氧核糖构成，碱基为侧链 规定：多核苷酸链以连接于5`-羟基的磷酸开始，以脱氧核糖的3`-羟基终止。 表示：pGpCpApT或pGCTA。 三、DNA的双螺旋结构 1953年Watson-Crick发表DNA双螺旋模型之前，人们已经取得的结果： 伦琴拍的第一张X射线图，1901年诺贝尔奖第一次颁发就给他 DNA双螺旋模型特征： 1、 DNA分子是由两条多核苷酸链围绕一个中心轴盘绕而成，两条链方向相反，一条为5`-3`，另一条为3`-5`。 4、双螺旋中，A与T配对二个氢键，G与C配对三个氢键 5 、相邻的二个碱基对不在同一位置（由于脱氧核糖中连接碱基的C并不正好处在螺旋的相对位置上），使二条链与中心轴的间距不同，在DNA双螺旋的表面形成大沟和小沟，酶等大分子自大沟进入，进行复制，调控等 2、 Z-DNA 美籍华人科学家王惠君和Rich研究寡核苷酸d（CG）x3的x射线分析后发现的（1979）。 六、重复序列 真核中有许多，据重复程度，分为三类： 二、中度重复序列 在基因组的重复次数不如高度重复序列高，不很集中，每一基因组约含103。有rRNA和tRNA基因、组蛋白基因，中度重复序列常以迴文顺序出现在基因组，杂以单拷贝序列 -AATTGTGAGCGGATAACAATT- -TTAACACTCGCCTATTGTTAA- 乳糖操纵子中的迴文结构 三、单一序列 多数蛋白质（酶）由单一序列的DNA编码的，数目在一到几个。真核生物基因组中单拷贝序列约占40-70%，其中仅有少数是编码的 七、超螺旋DNA 超螺旋DNA（supercoiled DNA）最初在SV40和多瘤病毒中发现 1、松弛态：双螺旋B型DNA分子呈直线时为DNA松驰态，最稳定 2、超螺旋 超螺旋是DNA的三级结构的一种普遍形式，由于受力的不同，可形成两种形式，负超螺旋和正超螺旋，又称为右超螺旋和左超螺旋。 溴乙锭、放线菌素D等分子扁平状，可嵌入DNA碱基间，使相邻碱基对间隔增加（0.7mm），超螺旋解旋，盘绕数减少，超螺旋向相反方向（右）旋转，为负超螺旋。 将螺旋的方向定为向上则向左转形成正超螺旋向右转即负超螺旋 第二节 DNA的理化性质 差异很大，分子量106-109，真核常在1010以上 SV40 3-106 T2或T4噬菌体 1.3x109 λ噬菌体 3.3x107 大肠杆菌DNA 2.2x109 流感嗜血杆菌 8-108 小鼠线粒体DNA 9.5x106 人第三对染色体 6.4x1010 DNA的长度纳米到厘米 φx174为0.6 μm， 果蝇巨染色体为4.0 μm 二、核酸的粘度 DNA分子具有很高的粘度。分子量越大其溶液的粘度越高，线形分子的粘度最大。DNA为线型，其长度与直径之比107，很稀的溶液也有极大的粘度，RNA粘度小得多。 四、核酸的紫外吸收 核酸紫外吸收峰值在260nm处，蛋白质的最大吸收值在280nm RNA浓度（μg/ml）= OD260 x 40 x 稀释倍数? DNA浓度（μg/ml）= OD260 x 50 x 稀释倍数 测磷的含量可定核酸溶液的光密度，以每升核酸溶液中1g磷原子为标准计算核酸的消光系数，称克原子磷消光系数， e(p)? e(p)=A/(CL) e(p)=30.98A/(WL) A为吸光度（光密度），L为比色杯内径，通常为1.0cm；C为每升核酸溶液中磷的摩尔数。W每升溶液中磷的重量（g),30.98为磷的原子量。 DNA