基因芯片技术标准浅析(.pptVIP

六 生物芯片技术(BIOCHIP TECHNOLOGY) 生物芯片技术 生物芯片（biochip）的概念 生物芯片（Biochip）是指通过机器人自动印迹或光引导化学合成技术在硅片、玻璃、凝胶或尼龙膜上制造的生物分子微阵列，根据分子间的特异性相互作用的原理，将生命科学领域中不连续的分析过程集成于芯片表面，以实现对细胞、蛋白质、基因及其它生物组分的准确、快速、大信息量的检测。 研究历史(Research history) 1991 Affymatrix公司Stephen Fodor:光刻与光化学技术、 多肽和寡聚核苷酸微阵列。DNA Chip概念 Stanford大学Brown实验室：预先合成，机械手阵列 1995 Schena等：基因表达谱 1996 Chee et al：DNA测序 1996 Cronin et al：突变检测 1996 Sapolsley Lipshutz：基因图克隆 1996 Shalon et al：复杂DNA样本分析 1996 Shoemaker et al：缺省突变定量表型分析 根据生物分子之间特异性相互作用的原理，如DNA-DNA、DNA-RNA、抗原-抗体、受体-配体之间可发生的复性与特异性结合，设计一方为探针，并固定在微小的载体表面，通过分子之间的特性性反应，检测另外一方有无、多少或者结构改变等 生物芯片（Biochip或Bioarray）是指包被在固相载体上的高密度DNA、抗原、抗体、细胞或组织的微点阵(microarray）。 未来十年最具发展潜力的技术。 生物芯片技术 生物芯片的主要特点： 高通量、微型化和自动化 特点 高度并行性：提高实验进程、利于显示图谱的快速对照和阅读。 多样性：可进行样品的多方面分析，提高精确性，减少误差。 微型化：减少试剂用量和反应液体积，提高样品浓度和反应速率。 自动化：降低成本，保证质量。 生物芯片分类 尚未统一。 广义上：矩阵型芯片、处理型芯片 固化材料：基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片 基因芯片（Genechip） 又称DNA芯片,是根据核酸杂交的原理，将大 量探针分子固定于支持物上，然后与标记的样品 进行杂交，通过检测杂交信号的强度及分布来进 行分析。 生物芯片技术 蛋白质芯片(proteinchip) 利用抗体与抗原特异性结合即免疫反应 的原理，将蛋白质分子（抗原或抗体）结合到固 相支持物上，形成蛋白质微阵列，即蛋白质芯片。 生物芯片技术 芯片实验室(labs-on-chip) 高度集成化的集样品制备、基因扩增、核酸标记及检测为一体的便携式生物分析系统。 实现生化分析全过程集成在一片芯片上完成，从而使生物分析过程自动化、连续化和微缩化。 芯片实验室是生物芯片技术发展的最终目标。 其他分类方法（根据应用） 基因变异检测芯片 疾病检测(如HIV、P53基因、结核杆菌) 法医鉴定(如DNA指纹图谱) 表达谱芯片 肿瘤相关基因(正常与肿瘤组织表达差异) 药物筛选(培养细胞药物刺激前后表达差异) 发育(同一组织不同发育时期基因表达差异) 组织发生(不同组织或器官的基因表达差异) 根据工艺和载体 1.原位合成法：密集程度高，可合成任意序列的寡聚核苷酸，但特异性较差，寡聚核苷酸合成长度有限，且随长度增加，合成错误率增高。成本较高，设计和制造较烦琐费时。 2.DNA微矩阵法：成本低，易操作，点样密度通常能满足需要。芯片的载体需表面紧质、光滑的固体，如硅，陶，玻璃等，DNA微矩阵芯片常用玻片为载体。 根据DNA成分 寡聚核苷酸或DNA片段：约20?25个核苷酸碱基，常用于基因类型的分析，如突变、正常变异（多态性）。 全部或部分cDNA：约500?5000个核苷酸碱基，通常用于两种或以上样本的相关基因表达分析。 基因芯片的种类 Science Chip：生物分析和诊断 Nutri Chip： 食物分析、转基因、污染检测 Leuko Chip： 血液分析、病毒分析、HLA分析 Aqua Chip： 水质分析 Secure Chip：含DNA的物质鉴定 Chromo Chip：基因分析和染色体序列 Prokaryo Chip：原核生物、兽医、环保等 基因芯片技术 （一）.概述 随着人类基因组测序计划的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展，越来越多的动植物、微生物基因组序列得到测定。 在GenBank数据库中已含有300万个序列，总数超过22亿个碱基对，其中包括19种不同生物体的完整序列、近9 000个已知功能或已推测功能的人类基因序列。 基因序列数据库正在以前所未有的速度迅速增长。 然而如何充分利用新序列信息资源，怎样去研究如此众多基因的生物信息及