9-李来兴-黑颈鹤（Grusnigricollis）越冬亚群之间-国际生物多样性计划.PDFVIP

黑颈鹤 （Grus nigricollis）越冬 亚群之间的隔离与交流 李来兴 中国科学院西北高原生物研究所 年 月 日 2018 8 16 呼和浩特 主要内容 • 问题的提出 • 研究方法 • 主要结论 • 讨论 问题的提出 • 局部种群的理解 • 科研数据的解读 • 观察结果的分析 • 保护实践的总结 存在重大误区 需要对黑颈鹤种群的亚群之间的基因 交流状况作出基本判断或分析 研究方法 • 种群规模评估 种群田间异步统计方法 • 亚群交流分析 遗传结构分析 肠道微生物群落比较方法 种群田间异步统计方法 遗传结构分析方法 肠道微生物群落比较方法 研究结果 • 黑颈鹤种群规模评估 • 黑颈鹤越冬亚群分布 • 黑颈鹤越冬亚群遗传树状图分析 • 黑颈鹤越冬亚群肠道微生物群落关系树状图分析 黑颈鹤越冬亚群分布 黑颈鹤越冬亚群之间遗传距离分析 黑颈鹤越冬亚群之间遗传距离分析 POP1为西藏自治区黑颈鹤种群，POP2为云南省黑颈鹤种群， POP3为贵州省草海黑颈鹤种群，POP4为米林县黑颈鹤种群。 大尺度聚类分析的结果，不出预料地显示 出项目评价区越冬黑颈鹤亚群，与西藏越冬群 类缘关系较近而与云贵越冬群类缘关系较远。 而当每个样本进行比较时，给我们给出了几方 面的提示。首先是一个日喀则的亚群，代表了 黑颈鹤最早的越冬群，而后分化出了分别在拉 萨地区和贵州草海越冬的两个亚群。最后一个 大类，代表了几乎整个黑颈鹤越冬栖息地的越 冬亚群，它们聚成了一个大类，包括了在评价 区分布的所有 个黑颈鹤越冬亚群， 3 黑颈鹤越冬亚群肠道微生物群落相似性比较 • 基于第二代高通量测序技术，不经过分离培养微生物，直接对样本中 微生物的DNA进行测定。不断更新的生物信息学分析方法，不仅可以 让科研工作者获得准确的不同环境中微生物群落的组成信息和多样性 信息，还可以根据不同的实验设计，比较不同空间或/和时间上微生 物结构发生的变化，寻找变化规律；与环境因子的关联性分析、共表 达网络分析、功能基因预测等深入的数据挖掘为进一步认知和理解环 境微生物群落供了有力的研究工具。 • 16S rRNA基因普遍存在于原核细胞，在细菌基因组中位于核糖体小亚 基 （约1540 bp），该区域兼顾保守性和高变性，含有10 个保守区域 (Conserved Regions)和9 个高变区域(Variable Regions)，保守区可用于 设计引物进行目的片段的扩增，而通过对高变区的分析可以辨别细菌 种类。因此，16S rRNA基因被认为是最适于细菌系统发育学研究和物 种分类鉴定。目前用于二代测序的区域主要有V3 区，V6 区，V1 区， V3-V4 区、和V4-V5 区等。 黑颈鹤越冬亚群肠道微生物群落相似性比较 采样策略 每个越冬群平 行采集3份黑颈鹤新 鲜粪便颗粒；越冬 地采集到82组样本。 黑颈鹤越冬亚群肠道微生物群落相似性比较