（毕业设计论文）《中国沿海日本鳗鲡遗传关系的D-loop分析》.docVIP

毕业设计（论文） （ 20 届本科） 题 目：中国沿海日本鳗鲡遗传关系的D-loop分析 学 院：生命科学与技术学院 专 业：水产养殖 班 级：（3）班 姓 名： 学 号： 指导教师： 20 年5 月 目 录 摘要： 2 前言 2 1 材料和方法 2 1.1 　样品采集 2 1.2 　总DNA 提取 2 1.3 　D-loop基因片段的PCR扩增 2 1.3.1 引物设计 2 1.3.2 PCR扩增 2 1.4 序列测定及数据分析 2 2 结果与分析 2 2.1 DNA提取 2 2.2 PCR扩增结果 2 2.3 序列变异 2 2.4 种群结构变异 2 2.5 系统关系 2 3 讨论 2 3．1 鳗鲡种群遗传结构和变异 2 3.2 系统关系 2 谢辞： 2 参考文献(References ) : 2中国沿海日本鳗鲡遗传关系的D-loop分析 摘要： 对2009年采集自中国沿海地区10个采样点、共119尾玻璃鳗的日本鳗鲡样本的遗传多样性进行D-loop分析。对控制区980个碱基进行分析。群体内遗传变异和群体间遗传变异对群体总遗传变异的贡献率分别为97.99%和2.01% ，十个采样群体两两间的遗传分化指数在-0.03554～0.12009之间。九段沙鳗鲡和其他群体之间可能存在相当的遗传分化，可能与采样时间有一定关系。而遗传分化指数及NJ树分析结果一致表明：群体之间的遗传分化不明显。在玻璃鳗采样群体未发现遗传差异同采样地点有显著关系，显示它们可能同属一个大混合群体。 关键词：日本鳗鲡；线粒体DNA；D-loop Genetic Relationship of Japanese eel (Anguilla japonica)from the Chinas Coastal by D-loop Analysis Abstract：Collected in 2009 from 10 sampling points in coastal areas in china, a total of 119 samples of glass eels of Japanese eel were duplicated for the D-loop analysis of genetic diversity. a total of 980 loci were amplified. The respective average genetic diversity index of the ten sample points of there are between every two sampling groups, genetic differentiation indices are from -0.03554 to 0.12009. the respective contribution rates of intra-cluster Genetic variation and genetic variation among populations of the group were 97.99% and 2.01%. in the process of glass eel samples, genetic differences had no significant relationships with sampling points and months.it is indicated that they may belong to a large mixed group. The genetic differentiation index and the NJ tree analysis results are consistent with that: The genetic differentiations between groups are not obvious. Key words: Anguilla japonica; mitochondrial DNA;D-loop 前言 日本鳗鲡(Anguilla japonica Temm．et Sch1)，属于降海产卵的洄游性鱼类，其生活史中包括了深海中产卵、孵化,然后至淡水湖泊和沿海成长的过程。卵孵化后随海流漂送，经柳叶鱼期的变态行为，而达到河口成为透明的“鳗线”，再顺着涨潮溯河而上成长。[1]肉食性，以小鱼及底栖生物为食物。日本鳗鲡营养丰富，味道鲜美，天然苗种和人工养殖主要分布在太平洋西部的一些亚洲地区，是这些地区目前人工养殖和出口创汇的重要水产品之一