一种通用的、基于agent的生物资源整合架构.pdfVIP

《上海生物医学工程》杂志 年第 卷第 期 == ? @ ·OP O · 一种通用的、基于!#$% 的生物资源整合架构 骆婷婷 马文丽 姚文娟 郑文岭 上海大学电子生物技术研究中心 （上海 ’’’( ） 【摘要】 众所周知，随着基因组测序工作的蓬勃发展和后基因组时代的到来，生物信息学数据呈指数级 增长。生物界在享受着资源共享所带来便利的同时，也随着数据总量和复杂性的不断增加而变得异构化和 分布化。目前，各种生物计算软件和数据库资源通常标准不一而且很难兼容。因此，如何在这些异构资源之 间实现数据集成与软件共享是有效利用生物信息资源的关键。为解决以上问题，本文提出了一种新型的数 据整合架构，该架构通过将)#* 服务与并行计算相结合的方法，轻松地实现了对异地资源数据的访问、提取、 转化以及整合。实验证明，本系统在处理异构、海量数据方面有着巨大的计算潜力。 【关键词】 生物信息学 异构资源