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生命科学研究快报
(半月刊)
2010 年4 月20 日第2 期 (总第181 期)
本期导读
假设驱动仍是当前生命科学研究的主要策略
科学家呼吁:世界需要“生命晴雨表”
国际癌症基因组联盟(ICGC )新进展
免疫学研究的文献计量分析(1)
导致1 型糖尿病的基因突变
肿瘤基因组译码揭示乳腺癌扩散的线索
中国科学院生命科学与生物技术局 主办
中国科学院上海生命科学信息中心 承办
目 录
要闻分析
假设驱动仍是当前生命科学研究的主要策略1
科学家呼吁:世界需要“生命晴雨表”2
政策与规划
国际癌症基因组联盟(ICGC )新进展3
文献计量
免疫学研究的文献计量分析(1)5
研究进展
糖尿病
导致 1 型糖尿病的基因突变8
部分胰腺细胞可自发转变为胰岛素生成细胞8
新型纳米颗粒疫苗可治愈 1 型糖尿病9
基因揭示:出生体重轻或许更容易罹患 2 型糖尿病10
激素对脑部神经元的作用能控制糖尿病和女性生育能力10
转化型研究
新型人工胰腺能够成功控制血糖浓度超过 24 小时11
Aeolus 制药公司启动 AEOL 10150 二次研究12
肺结核
治疗肺结核的新方法12
乳腺癌
肿瘤基因组译码揭示乳腺癌扩散的线索13
生命科学研究快报 1
【要闻分析】
假设驱动仍是当前生命科学研究的主要策略
据《自然》杂志报道,以研究肿瘤享誉生命科学界的麻省理工学院教授温伯格认为,假
设驱动仍是当前生命科学研究的主要策略。而温伯格的同事则在另一篇文章中针锋相对地提
出,生命科学研究应该由数据驱动。
(1) 系统生物学发展背景下的假设驱动
温伯格认为,历来被视为描述性科学的生物学,在 20 世纪成了一种假设驱
动的实验。与此密切相关的是愈益占主导地位的还原论,亦即可通过分解结构成
分予以离析研究来理解复杂的生物系统的观念。尽管人类基因组等研究计划的成
功不容置疑,但这并不意味着要取消二、三十个假设驱动的小规模项目。
上述的不同研究模式之争,是在人类基因组、肿瘤基因组等“大科学”项目
不断开展、系统生物学思想的发展下进行的。回过头看,“人类基因组计划”的
发起人之一,美国科学家莱诺伊·胡德(Leroy Hood ),也是系统生物学的创始人
之一,曾经指出,系统生物学的基本工作流程有这样四个阶段。首先是对选定的
某一生物系统的所有组分进行了解和确定,描绘出该系统的结构,包括基因相互
作用网络和代谢途径,以及细胞内和细胞间的作用机理,以此构造出一个初步的
系统模型。第二步是系统地改变被研究对象的内部组成成分(如基因突变)或外
部生长条件,然后观测在这些情况下系统组分或结构所发生的相应变化,包括基
因表达、蛋白质表达和相互作用、代谢途径等的变化,并把得到的有关信息进行
整合。第三步是把通过实验得到的数据与根据模型预测的情况进行比较,并对初
始模型进行修订。第四阶段是根据修正后的模型的预测或假设,设定和实施新的
改变系统状态的实验,重复第二步和第三步,不断地通过实验数据对模型进行修
订和精练。系统生物学的目标就是要得到一个理想的模型,使其理论预测能够反
映出生物系统的真实性。也就是说,已有知识、“假设”和“数据”缺一不可。
(2 ) 技术发展、系统生物学和合成生物学的发展
值得关注的是,除了上述的知识、“假设”和“数据”,技术的发展也是不容
忽视的动力。事实上,“人类
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