分子流行病学在疾病预防控制中的应用-预防05级.pptVIP

分子流行病学进展及其在疾病预防控制中的应用Molecular Epidemiology and its Application in Disease Prevention Control;分子流行病学的定义（Molecular Epidemiology）;Cancer;传统流行病学;Medical Practice etiology diagnosis treatment prevention;分子流行病学的特点; 分子流行病学的发展趋势 研究手段越来越多,技术越来越成熟 研究内容(生物标志物)越来越丰富 应用范围越来越广（病因、危险度评估、早期诊断、个体化治疗） ; 生物标志（biological markers, biomarkers）是可以测量的、能代表生物结构和功能的大分子物质，如DNA、RNA (miRNA)或抗原、抗体、蛋白质（酶）等。;一、暴露标志（exposure marker）;内暴露剂量包括对化学毒物、饮食中的营养素和可能致癌剂以及微生物感染的测定。例如：;体内剂量标志;生物有效剂量标志;二、效应标志（effect marker）;生物学效应标志;三、易感性标志（环境-基因）;α1抗胰蛋白酶 ; ; 人类基因组计划研究结果表明，不同个体的基因99.9%是一样的，但在序列上有极小(0.1%)的遗传差异，其中主要是 SNP。 SNP是指在人群中出现的频率?1%的先天突变。SNP存在于整个人类基因组中，可能每100~300bp就存在一个SNP，估计总数在数百万个。 研究表明，正是这0.1%的差异授予你我他特有的表型；这个小小的差异还与个体对疾病(包括肿瘤)的易感性、对药物的反应性差别有密切关系。;;;Human Genome Project ;单核苷酸多态与人类个体差异;单核苷酸多态与个体疾病易感性差异;Cancer;NSCLC;基因检测- 危险度评价;从科学研究 ?临床实践;人类基因组流行病学 ;分子流行病学常用技术及方法;PCR-RFLP PCR-SSCP, PCR-based resequencing Real-time PCR Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI) mass spectrometry Dynamic allele-specific hybridization (DASH) DNA-chip analysis DHPLC;illumina 高通量基因分型平台;SNPstream基因分型系统;Automated Liquid Handler SpectroPREPTM;核酸分子杂交;蛋白质检测鉴定系统;酶联免疫吸附试验（ELISA）;高效液相色谱(HPLC, LC/MS/MS);Accessible Genome and Genetic Variation database;分子流行病学在疾病预防和控制中的应用;丙型肝炎病毒基因分型;1a, 1b 2a, 2b, 3a;如SARS 在广东流行可分三个阶段: 早期由病人分离到的SARS 病毒与果子狸分离到的SARS 病毒高度同源,因此怀疑SARS 是一种动物来源的疾病。;案例：1990年7月，美国佛罗里达州一名AIDS妇女，怀疑在当地一牙科诊所手术时感染了HIV，因为该诊所的牙科医生也是一名AIDS患者。随后当地卫生部门对该牙医诊治过的一千余名患者进行HIV检测，共发现7名HIV感染者有在该诊所的就诊史。 那么这7名HIV感染者是否与该牙医有关呢？;针对这一问题可采取的分析方法： 1、传统流行病学分析方法：接触者调查，分析感染者可能的危险行为如输血、静脉吸毒、不洁性交史等。 2、分子流行病学方法：比较HIV病毒基因序列的差异，分析不同病例感染株遗传关系的远近。;与牙医感染株的遗传变异性比较;病人D;以结核为例：与结核病人密切接触，感染和发病的危险增加。这些接触者与源病例之间，是否产生了结核分枝杆菌的传播？ 开展结核病成“簇”性研究，可以从分子角度解答这样的问题。 成簇的过程就是用聚类分析对分离株的基因进行分型或分群的过程，可以分析结核病的传染源和传播途径。;结核杆菌DNA指纹图谱有助于基因分型 ;Bauer等对丹麦1549株结核菌进行IS6110为基础的DNA指纹分析，成簇率49%。同样方法检测格陵兰岛成簇率为79%。 ;; 江苏省北部地区(苏北) 在2003年1-7月爆发了较大规模的无菌性脑膜炎,涉及范围之广、发病人数之多,在国内较少见。;疾病暴发原因分析;2、非传染病的病因及病因致病机制的研究 例：载脂蛋白与心血管疾病 HBV感染与肝癌（基因组整合） EBV感染与