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磁共振成像仿真平台设计和实现
磁共振成像仿真平台设计和实现
作者简介作者简介:水力(1987-),男,中南民族大学生物医学工程学院硕士研究生,研究方向为磁共振成像。0引言
磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)是一种利用核磁共振原理进行人体断层成像的技术[1]。近年来,随着磁共振成像技术的不断进步,其成像设备的研发得到了飞速发展,对MRI系统成像方法以及临床应用等方面的研究工作也日益增多。但磁共振成像仪是一种昂贵的医疗仪器,研究人员常常需要用仿真方法来检验他们的研究结果,此时,磁共振成像仿真平台的建立尤为必要。MRI仿真平台可方便研究人员比较和评价数据采集和图像重建的新算法。在研究中,一般先借助仿真模型,通过人工合成数据验证算法的可行性和准确性。模型数据测试可行后,才用MRI扫描仪得到的试验数据进行验证。利用仿真平台进行图像重建算法研究的优点是: 模型是已知的,重建结果有可比较的参考对象,而且可以按照成像原理获得不同采集模式的数据,算法研究前期可节省用扫描仪采集数据的花费。
本文利用Matlab图形用户界面仿真MRI成像过程,模拟K空间数据采集和图像重建。该平台模拟了线性、螺旋及并行扫描3种成像方式,可以导入不同模型图像,设计K空间扫描轨迹,模拟K空间数据采集过程,并显示采集信号的波形。还对3种成像方式的图像重建方法进行了实现,对重建误差进行了分析。界面简明友好,为后续MRI成像算法的研究提供了一种有效工具。
1软件系统设计
本文介绍了Matlab图形用户界面开发环境GUIDE[2],实现了磁共振成像仿真模拟平台的结构和功能。该软件可以实现MRI模型图像导入、模型切换、K空间轨迹设计[3]、K空间数据采集、图像重建以及误差分析等功能。是学习以及进一步研究磁共振成像方法的有力平台工具。磁共振成像仿真平台软件由图像导入系统、K空间轨迹设计和数据采集系统、图像重建系统三大功能模块组成,如图1所示。
图1软件系统模块
2软件系统功能
采用Core2-3.0G CPU,1.99G内存和120G硬盘的PC机在Matlab2007上实现,软件界面如图2所示。
以下分别对软件各个模块的功能进行介绍。
2.1图像导入系统
通过选项框有5个图像模型可选,如图3所示,分别为不同分辨率的Shepp_logan模型和分辨率为128×128和256×256的头部模型,点击显示图像按键后导入图像到指定轴。
2.2K空间数据采集系统
K空间数据采集系统分为K空间轨迹设计和模拟数据采集过程的信号波形显示两个部分。
目前,本仿真平台研究了3种采样轨迹的设计和数据采集:①等间隔采样轨迹,即线性采集;②均匀螺旋轨迹设计和采集;③并行轨迹设计和采集。根据扫描轨迹设置相关参数设计出K空间填充轨迹后,再利用模拟数据采集的过程,得到图像重建需要的K空间数据,即采集到的信号。其中线性、并行扫描显示的是一行行采集波形,而螺旋扫描显示的是一支支采集波形。
图2软件界面
图3导入模型
在数据采集波形显示部分,设置了多种扫描方式:单行(支)数据采集、连续动态采集,以及轨迹扫描和波形显示的动态同显。本界面还设计了良好的排错系统,使得界面更加人性化。
2.2.1线性采集
等间隔采样又称笛卡尔网格采样,它在K空间中是等间隔均匀采样,即基于线性填充轨迹的数据采样。在数据采集期间,所得数据沿Kx方向依次存放,Ky不变,采集的数据从左至右地顺序写入K平面的第一行,本行数据写完后,Ky加一再写第二行,直至写完。标准的2D K空间的标记轨迹为K空间内的一组平行线,即线性轨迹。如图4所示。
其频域信号为:S(kx,ky)=??Mxy(x,y,t)×
exp(-j(kx(t)x+ky(t)y))dxdy(1)2.2.2螺旋采集
螺旋轨迹的形式很多,本文采用的是均匀螺旋K轨迹(dK/dθ为常数)阿基米德螺线(Archimedean spiral)。在笛卡尔坐标系中,阿基米德螺线K轨迹可表示为:
图4等间隔K-空间采样轨迹Kx=Kcosθ=Aθ(t)cosθ
Ky=Ksinθ=Aθ(t)sinθ (2)螺旋轨迹一般从K空间中央出发,然后呈螺旋状向外扩展,轨迹如图5所示。其中,(a)是采集单只螺旋轨迹,(b)是采集20支螺旋轨迹。
图5均匀螺旋采样轨迹
2.2.3并行采集
并行磁共振成像的数据用相控阵线圈,以加速因子(acceleration factor)R 进行采集,也就是每隔R个相位编码步做一次相位编码步数据采集,如图6所示。
(a)(b)
图6线性和并行采集的K空间
(a)为正常采集的K空间数据示意图,每一条横
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